(一) 财经类课程教学中缺乏科教融合理念的指导，教学与科研脱节。
虽然我国很多高校在人才培养方面采用了研讨式教学模式，但在高校财经类课程教学中，对以科教合一为主导的会计人才培养理念认识不足。因而教学与科研脱节，研讨式教学达不到应有的效果，直接导致了对学生的科学研究和创新能力培养不足。主要表现在课程、教师资源以及学生素质等方面。
首先，目前我国高校科研课程较少，研讨教学中课时安排不足，导致学生对学科问题的探讨不够。其次，目前我国高校财经类专业师资不足，会计学科带头人和科研经验丰富的教师更是寥寥无几。教师如何在课堂教学中把握教学重点，能否在教学中对学生的科研水平起到指导作用，都面临挑战。最后，科教结合的讨论式教学模式对学生的素质提出了更高的要求。然而，目前我国大学生还缺乏参与学科研究的主动性，创新思维和批判性思维训练更是有限。
（二）“研讨式”教学方法应用于财经类课程教学尚未形成可推广的教学模式
当前“研讨式”教学方法已经在高等教育各学科各类课程的教学实践中得到应用，在财经类课程教学中也有相应的应用与探讨，但是尚未形成可广泛推广应用的教学模式，在应用过程中不仅面临着与其他课程相同的一些共性问题，同时在教学理念、教学目标、教学方式以及教学资源等方面也面临着一些独特的个性问题。
1、受传统教学理念的影响，缺乏以学生主体的对话氛围
虽然已进行了一定科教融合的研讨式教学模式改革的初步实践，但是多数教师的授课方式及教学理念依然停留在“教师讲，学生听；教师问，学生答”的模式上，老师在课堂上仍然习惯于满堂灌的填鸭式教学，忽视学生的主体作用，大多数学生仍然习惯于课堂上的被动状态，缺乏主动的学习兴趣和科研探索精神，不敢质疑老师，不敢提出自己的见解，师生之间缺少平等对话的氛围。
2、“研讨式”教学方法在教学过程中的具体应用存在多方面问题
一是课程缺乏指导，过分强调加强主修课程的理论知识，注重书本知识的教学，较少注重讨论和实践。二是教学方法缺乏创新。虽然也采用了多媒体教学、网络教学和案例教学，但交互教学、情境教学等教学方法尚未推广。第三，评价方法相对单一。学校对学生的考核主要以考试成绩为主，缺乏对独立判断能力、创新能力、实践能力等的考核，制约了现代复合型财务会计人才的培养。
（三）基于科教融合的“研讨式”教学方法应用过程中的教学资源平台单一，资源投放不足
1、“研讨式”教学方法应用过程中的教学资源平台形式单一
财经类课程教学的教学资源平台往往局限于校方官网，访问空间受限，访问资源有限，难以满足课堂教学外“研讨式”活动开展的需要，另外还存在过多注重课堂上的师生交流，忽视师生课下交流的问题。
要利用翻转课堂等方式拓展研讨式教学的广泛应用，应当打开思路，充分利用互联网和移动信息终端，建立“全天候”师生信息交互平台，如QQ群、微信群等，建立“公私”兼备的各种师生互动平台的组合式平台。
2、教学资源平台资源投放不足
校方官网上教学资源投放往往局限于专业培养方案、精品课程、网络课程等，缺乏对教学内容的针对性，更缺乏与“研讨式”教学方式的契合，无法满足研讨式教学对研讨资源的需要。
开展基于科教融合的“研讨式”教学则需要更多的教学素材与研讨资源，因此如何合理利用“知网”等研究资料资源，如何将浩繁的网络资源适度链接或导入教学资源平台是开展研讨式教学必须解决的问题。