当前，湖南省农村中小河流河长制工作已全面开展，以“一河一策”实施方案为技术支撑，以水资源保护、水域岸线管理、水污染防治、水环境治理及水生态修复为主要内容，通过“问题查找—目标设置—任务措施制定”，统筹河流上下游、左右岸关系，发动河流利益相关方共同决策、联合执法；社会公众广泛参与管理监督全面开启河流管护工作，并逐渐步入全面落实阶段。受人类活动影响近年来农村河道生态环境历史问题存量大，并且我省农村中小河流在“十二五”期间仅对局部重点河段进行了整治，农村中小河流的治理与修复任务并重，河流综合管理与保护面临新挑战。基于河长制工作，农村中小河流存在的主要问题及特点有：
（1）水安全问题
防洪能力偏低，农村河段堤防防洪标准仅2～3年，且河床有逐年淤积抬高趋势，防洪压力增大。供水安全问题堪忧，部门农村中小河流承担着灌溉供水、生活供水、乡镇企业用水的任务，供水水源季节性断流与水质污染成为供水安全主要影响因素。
（2）岸线滥占乱用明显
农村中小河流为两岸人口相对密集，农田、菜地、牲畜棚等沿河而建，生活建筑垃圾沿河倾倒，河道行洪空间缩小，两岸生态退化。
（3）水闸、河坝、桥梁等涉河建筑物多，普遍存在“重建轻管”现象，建筑物年久失修，多不可用，或成阻水建筑。
（4）生态环境较脆弱。农村河流多年平均径流量较小，水环境容量小，河道内水位流量受降雨条件影响易涨易跌，自我调节能力较差，河道宽窄不一，与沟渠、山塘等小微水体的连通性较差，“哑河”段或“死水”常见，水体自净能力差易发黑发臭。
（5）污染源多，环境承载压力大。污染源点多面广、污染物收集困难，毗邻河流的山塘、小沟、小溪多为水产养殖区，农业面源污染、畜禽养殖污染问题突出，矿区、坡耕地等不合理的开发利用造成水土流失成为面源污染最重要来源[8]，且村镇污水收集处理设施建设滞后，旁支、沟渠成排污明沟。
农村河流河长制工作开展以问题为导向，结合各区（县）发展定位，因地制宜，实行河流多目标管理。以“非工程措施为主，工程措施为辅”，通过河长巡河护河、“清四乱”、非法采砂整治、矿山整治、畜禽养殖污染整治、农药化肥施用控制等专项行动，精准施策。