1、加强先修课程的配套性
在课程设置中可适当对工具性较强的课程设置单独的应用课程，比如数学类课程是金融工程在内的后续诸多专业课程的基础之一，掌握数学工具对于理解金融工程中模型、公式的经济含义有重要意义。因此，在课程体系建设中，可就前期理论性强、工具性强的课程适当安排实践应用方面的学时或者单独开始相应的应用课程。例如在数学概率论这一章节之后安排相应的概率论的应用课程，让学生掌握概率论在金融工程、投资学等其他专业课程中的实际运用，应用课程应与后续课程建立前后承接。
2、注重后续课程的应用性
应用型高校重在“应用”二字，旨在培养具有较强社会适应能力和竞争能力的高素质应用型人才，满足和适应经济与社会发展的需要。学生在学校里学习专业课程，不仅要从中获得专业知识，还要有获得一定的应用能力，即实际操作的能力。就目前金融专业的课程体系来看，金融工程后续的相关课程很少，即使有也是以理论为主，缺乏应用性。鉴于此，在课程体系上可在金融工程课程后续开设相关的独立实训课程，如厦门大学的金融工程实训课程体系，将理论知识中的每个模块进行实践实训，通过设定情景，让学生在特定场景下用金融工程的方法解决金融财务问题。
另外，在学生积累了一定的专业知识后，如大三至大四的学生应以应用为主。除了以课程的方式，还可以通过项目、产品设计等方式来实践。通过建立实验实训教学中心，提高学生创新创业能力，让学生在实训教学中心学习，模拟在真实企业中进行运作和决策。例如，金融企业模拟实训操作中，同学们分为银行组和企业组进行实战操作，通过真实的项目开发，衍生产品的投融资，金融资产的套期保值和套利等，体验银行和企业做决策和资金规划的过程，充分提高自身的综合能力。
应用型高校的实训中心可采用三种模式建设，一是采用产业校园模式，即学校与社会企业在统一的生产经营管理理念下开展教学与生产经营活动，产学研结合；第二，技术应用公司模式，通过与企业合作，学生教师共同帮助企业解决生产中的技术问题，培养创新型技术人才，获取企业效益；第三，工作基地模式。工作基地是按照公司的运作流程开展生产经营活动，与社会企业建立良好的联系，以提高学生的专业实践技能。
3、调整课程理论与实训的安排结构
金融专业课程具有文科和理科相融合的特点，既需要进行模型的构建和推导、公式计算，又需要对经济模型的含义进行理解，并对目前所存在的经济现象进行解释、经济问题加以解决。由于这个特点，对于金融专业课程而言，理论和实训两个部分缺一不可，两者互相配合、相辅相成。以金融工程为例，可进行课程改革，课程可按照三部分来设计，即理论课程（知识点）+实训课程（运用能力）+双师型讲座（前沿热点）。就实训课程而言，可设计相应的实训方案体系，训练学生对知识点的掌握和运用情况，同时兼顾培养学生的研究能力。