网络是人们现实生活空间的延伸，革命性地改变了人们传统的社交版图与思想格局，打破了传统的文化传播方式与交流方式，直接导致思想文化在网络空间激荡发展，大大加强意识形态领域多种话语交锋态势。特别是在网络意识形态安全中，我国明显处于“敌强我弱”的地位，给增强网络意识形态凝聚力和引领力带来巨大挑战。
一方面，来自西方国家的挑战。西方国家掌握着网络技术霸权和话语霸权，已经构建起完善的思想宣传体系，能够直接引导国内外网络舆论动向，直接威胁着我国网络意识形态安全。一是西方国家掌握网络技术霸权，为本国意识形态工作服务。虽然近年来我国在硬件技术和软件技术方面取得一定成效，但是以美国为首的西方国家控制着网络运行的中枢神经，牢牢把握着网络控制权，并以此为媒介极力制造符合本国国家利益需求的网络制度和网络秩序，牢牢占据网络意识形态的主动权。二是西方国家掌握着网络话语络霸权，思想渗透力度加强。西方国家凭借网络话语霸权优势作用，加强通过网络肆意诋毁我国的国家制度、政党和政府形象，宣扬历史虚无主义、普世价值观等，企图煽动我国人民自发进行政治变革，以促进西方国家和平演变政治目的快速实现。三是西方国家网络宣传体系完善，网络舆论引导能力强。西方国家依靠自身完善的网络传媒体系，引导和影响网络舆论动向，极力向全世界传播对自己有利的网络信息，以及各种反社会主义思潮。同时，肆意传播和兜售蕴含着西方价值观和西方意识形态的文化产品，无形中消解和弱化了我国优秀文化在人们日常生活中的作用，进而企图控制我国人民思想、颠覆国家政权。
另一方面，来自我国国内的挑战。我国网络治理能力和网络舆论引导亟待提升，不能适应维护网络意识形态安全的要求。一是网民数量度激增，导致对网民思想管控难度大。据第43次《中国互联网络发展状况统计报告》显示，“截至到2018年12月底，我国网民规模已达8.29亿，全年新增网民5653万，互联网普及率为59.6％，较2017年底提升3.8个百分点。” 这对我国加强网络空间治理提出新的要求。二是网络空间各种社会思潮泛起，增加思想凝聚难度。随着网络技术的创新发展，人们思想文化交流的时空限制已经被打破，各种非马克思主义、反马克思主义的社会思潮通过网络在我国广泛传播，多样化的社会思潮在网络空间互相激荡，严重扰乱了我国网民的思想认同和价值选择。三是网络空间自主性增强，思想引导难度增大。改革开放以来，我国人民群众的思想活动呈现出差异性、独立性、选择性、多变性等特点，价值观念也随之发生深刻变化。特别是互联网时代的到来，使得网络信息的作者、读者和传播者呈现一体化趋势加强，每一个人都可以借助网络载体表达自己的诉求和见解。人们在网络生活中，自行构建主流意识形态认知标准的趋势加强，使得网民在价值取向上出现多元化趋势。而且，一些不健康、不和谐的思想因素也在网络空间传播，对网络意识形态认同产生严重冲击。四是我国网络安全人才失衡、素质有待提升。目前，我国正在由网络大国向网络强国转变的瓶颈期，维护网络意识形态安全的人才需求量急剧增加。然而，我国培育人才的速度不能适应需求速度的增长。维护网络安全的人员不足，不仅体现在数量上，还表现在不同种类人才的失衡。比如说，网络技术、网络管理等方面人才比较缺乏。而且，虽然我国网络意识形态安全人员在管理和技术方面有一定的基础和能力，但是，普遍存在着知识零碎、管理不成体系等方面的先天不足。