（一）管理意识淡薄。医院固定资产管理存在众多问题，究其原因，一个重要方面就是管理意识淡薄。这种意识淡薄不仅仅表现在管理层，同样表现在使用部门或者直接使用人身上，例如：盲目追求资产数据的保值增值，资产随意处置，历史遗留问题长期不愿去解决，直接使用人对资产的使用缺乏责任意识等。
（二）缺乏有效的管理模式和制度体系。有效的管理模式和制度体系是不断提高固定资产管理效率和效果的基础，但现阶段很多医院存在资产管理重点不明确，制度不完善，职责不清，内控监管不到位等情况。
（三）管理人才缺乏。据统计：2018年xx省12家省属医院每床位占用固定资产20.39万元，而医院国资或财务固定资产实际管理人员平均2人，且部分人员兼有会计核算或其他岗位职责。随着医院不断发展，资产规模不断扩大，管理要求越来越高，管理人才的缺乏将严重影响固定资产管理工作的有效开展。
（四）信息化程度偏低。加强信息化建设是提升医院资产管理水平的重要途径，但医院固定资产有其自身的独特性，加之各家医院实际情况不同，这给信息化建设带来很大的难度。
(五)效益分析不到位。现今，医院基本上都对固定资产进行了不同程度上的效益分析，但大多集中在对大型医疗专用设备的分析，且很多分析流于形式，并不能为管理决策提供有效的依据。
（六）基础数据质量偏低。目前存在“一卡多物”、“维修费单列资产卡片”、“在建工程投入使用长期不转产”、“报废资产不清理”等现象，直接导致固定资产基础数据质量偏低。2018年财政部门结合2017年财政资产报表情况，逐步优化了资产管理信息系统，并开展了资产数据信息整改工作，大大提升了医院固定资产基础数据质量。整改虽取得成效，但却无法在短期内改变目前资产管理的现状，而基础数据质量的高低又直接影响信息化、制度化等固定资产管理工作的效率和效果。