教育政策分析的逻辑起点是政策问题的提出，然后是教育政策方案的制定与出台，后面就是教育政策执行。政策学家指出：在实现政策目标的过程中,方案制定的作用占10％,而其余90％取决于有效的执行。所谓教育政策执行，是指“教育政策的执行主体根据教育政策的目标，通过一定的教育资源配置方式，将教育政策的方案转化为现实的动态过程”。教育政策执行也就是“政策执行者通过建立组织机构和运用各种政策资源，以及采取解释、宣传、实验、实施、协调与监控等各种活动，将政策观念形态的内容转化为实际效果，从而使既定的政策目标得以实现的动态过程”。

独立学院“转设”政策执行存在多个差别化的利益主体，政府、独立学院、投资方、母体学校等在政策执行过程中基于差别化的利益追求而不断进行利益关系的博弈，不同相关利益主体之间通过制度完善或者方法策略来调整彼此之间的利益关系以尽可能达到一种利益的均衡，这是解决独立学院转设问题的一大关键。而博弈论正是研究相互影响的决策参与者的理性决策行为及其结果的理论。美国公共政策学者尤金·巴达克在《执行博弈》中提出了政策执行的博弈模型，强调政策执行是一个各方进行利益博弈的过程，政策执行的有效性一部分取决于各利益相关者的策略选择，如何把控博弈各方的行为就成为执行成败的关键。巴达克在“博弈理论”中将公共政策的执行过程视为一种竞争式比赛，在这个过程中每个参赛者都会尽量追求自身利益的最大化，而公共政策理论学家也认为公共政策的实质是利益的博弈与划分，不同利益主体的利益驱动在一定程度上会造成公共政策的执行与偏差。

基于此，在独立学院转设过程中，可以将独立学院作为利益相关者相关行为主体之间的博弈对象进行分析，“独立学院转设政策执行过程中的利益关系博弈主要是在政策制定者与政策执行者、政策执行者与政策对象以及政策对象之间进行”。从博弈理论的视角对独立学院的转设政策执行进行分析，独立学院转设政策的执行过程是不同利益相关者利益驱动的过程，不同利益相关群体利益博弈激烈程度会影响政策执行的实际效果，当不同利益群体之间的利益博弈不能在一定程度上达到均衡，独立学院的转设政策便不能真正的执行，所以必须要破除这个重要障碍。