（一）机构和组织职能与效率衰减的规律以及孔子学院的运作现实
任何机构或者组织在发展的中期都会遇到绩效衰减的问题。美国经济学家阿尔伯特·Ｏ·赫希曼（2001）认为，任何经济社会和政治体系中，总体上看，个人、企业、组织都具有从富有效率、理性、守法、高尚的行为模式滑向衰落的倾向，或者说，运行如常的行为模式会逐渐出现瑕疵[2]。吴应辉（2011）指出：目前的孔子学院不论从理论上还是实践上看，都还处在一种松散的联合体中。……任何一方对另一方都不具有绝对支配权，换句话说，任何一方都可以有相当大的自主权决定自己在联合体中要扮演什么样的角色，可以深度参与，也可以敷衍了事，可能精诚合作，也可能离心离德。强制退出机制将有助于上述问题的解决[3]。
（二）孔子学院依然面临被质疑和不被充分信任的问题
在国外，特别是欧洲和北美，外方根深蒂固的质疑与批评依然存在。2004年全球第一座孔子学院成立，发展非常迅速，反对批评的声音就一直存在。早在2008年，孔子学院涉嫌“干预学术”（Academic Interference）的问题就被提出来。当时斯德哥尔摩大学教职员工要求终止与孔子学院的合作关系，认为“中国驻斯德哥尔摩大使馆利用孔子学院实施政治监控、隐性宣传以及禁止研讨敏感话题”。到了2011-2013年的时候，孔子学院面临的质疑的声音越来越大。孔子学院在全美的地域分布和战略布局为中国对美公共外交的开展提供了很好的平台，但却遭遇美国国内的强烈质疑，认为孔子学院是一个文化入侵机构、政府的政治宣传工具。美国学者（James Paradise，2009）更是将孔子学院比喻为“特洛伊木马”，认为“孔子学院外表温和宽厚的形象实际上包含了政治野心” [5]。有着官方背景的孔子学院在进行文化渗透，在扩张意识形态。2012年5月的美国国务院针对孔子学院中方教师的“签证风波”表明美国境内的孔子学院生存环境是复杂的。在日本、澳大利亚、欧洲个别地区也有类似的反对声音。国内一些学者喜欢把这些质疑与批判称作“偏见”，其实这是一部分欧美人的真实看法。我们一方面要防止自话自说，另一方面要重视他们的关切，当他们说到孔子学院妨碍到了他们的“学术自由”时，我们不能草率地说“这会是一种偏见”，是“学术自负、思想狭隘的表现”，是“无端指责”。这些质疑与批评的背后有着清晰的逻辑和深刻的背景，有着深层次的地缘政治原因和宗教文化信仰等原因。
1.美国对中国的战略疑虑与防范
对于中国力量的迅速增强，美国人就如何应对中国展开了争论。布鲁金斯学会资深研究员杰弗里•贝德（Jeffrey A. Bader）（2016）谈到三种对华策略：1.适应。2.遏制、对抗或无限制的战略竞争。3.全球合作与区域决心。这一阵营相信前两种方案均有合理之处 ，但激进地、单独地使用其中任一手段均不恰当[6]。特朗普本人及其政策幕僚更多持有的是对华“遏制”的强硬论调。这样的精英舆论态势对中美公共外交提出了严峻的挑战。
裘援平（2019）谈到2018年以来的国际形势主脉清晰，几大全局性结构性矛盾集中显现：全球化与反全球化的激荡，霸权国家与崛起大国的对立。中国占美国经济总量约63%，印度经济保持快速增长之势，世界前十大经济体排名不断变化。国际力量更加多元化，国际舞台角色多样化，国际权力趋于分散化，单一国家独霸世界“强权势力主宰世界”难以为继。这些变化产生的整体效应局部感受和心理冲击，足以引起霸权国家和守成大国的高度警觉和焦虑不安，萌生全面启动预防性遏制战略的冲动。美国国家安全军事防务和各地区战略陆续出台，以中俄为主要战略威胁、主要竞争对手、主要防范对象和主要假想敌进行调整更新]。（唐永胜 李 薇，2019）认为战略竞争加剧是中美结构性矛盾增强的结果，也是“修昔底德陷阱”效应某种程度的显现。如果说几年前美国还把中国界定为“潜在威胁”，现在则将中国不断增强的实力视为日益上升的“现实威胁”并着力加以遏制和围堵[8]。在政治遏制、军事防范、贸易战、科技战的背景下，人文交流领域也出现了较大的变化。韦宗友（2019）研究发现从2017年起美国国内掀起了一股质疑中美人文交流、抹黑中国在美人文交流活动的强劲逆流。2017年美国全国学者联谊会发布了一份报告，指控“孔子学院通过向学生提供经过筛选的知识，展示中国正面形象，可能会对整个一代的美国学生产生误导”，建议所有美国大学关闭孔子学院。美国政府问责办公室在2019年2 月发布的一份关于中国在美国孔子学院运行的调查报告。大部分受访者指出，在涉及学术会议主题或会议嘉宾等方面，学校教师有完全的自主权，很多人表示汉办从来没有因为会议主题而拒绝在孔子学院举办活动，孔子学院并没有对所在学校的课堂讨论、研究主题或学术活动产生限制。不过，调查报告指出，一些受访高校行政人员表示，当前孔子学院在美国受到的负面关注，可能会影响到他们是否继续维持孔子学院的决定，部分高校管理人员在考虑是否关闭孔子学院或者将其搬出大学，转移到社区。
