教育科研课题管理是教育科研管理者为了确保课题预期研究任务的完成而展开的一系列组织协调活动。当前区县课题管理过程中主要存在重立项轻鉴定、管理相对松散、成果转化滞后、管理制度缺失等问题。针对存在的问题，探索出区县域教育科研管理的“三分”精细管理模式，即“分层”、“分段”、“分流”。
“分层”就是按照科研级别和学科类型，在立项、过程、结题鉴定等方面实行分层管理，也体现在让各个学校参与本单位课题研究的真实管理。科研级别按课题立项级别分为四级：国家级、市级、区级和校级。国家级和市级课题的管理指导由区内学术委员会主任、学科研究员等负责管理指导，前期由区级科研部组织指导与研究交流，后期邀请市教科院专家指导与组织交流。区级课题由区级科研部、区内专家库成员负责管理指导，校级课题由学校教科室、校内骨干教师负责管理指导，初步形成以区级科研部、学科教研员、名师团队、教科研骨干、校级科研部为五个层级的科研组织机构及运行体系的市、区、校分层管理，分层指导模式。但所有级别的课题都归课题所在学校教科室直接管理，不同级别的研究课题都是校本研究课题。任何一个专题研究，任何一个难关的解决，都体现出指导专家和课题主研的主动性和责任感。课题所在学校也主动出谋划策，不惜人力物力，积极推动课题研究的深入开展。
“分段”即为过程管理，监管研究的每一过程，按时接受阶段性成果的鉴定。一般来讲，课题研究过程分课题立项开题阶段、实施研究阶段、准备结题阶段、鉴定推广阶段。通常重视开题、结题的管理与指导，忽略的是实施研究阶段。经过开题之后，研究工作进入组织实施、解决问题阶段，也是最关键阶段。组织开展专题科研活动、组织阶段总结、疑难研讨、留存相关资料、撰写阶段性小结等。B区教研机构在抓好学校教科室主任、课题主持人的培训与管理的同时，重点实施了教科研一体化管理制度。将教研、科研管理一体化，实行学科教研员指导课题制度，将课题按学科分类落实到学科教研员，学科教研员不仅参与开题、结题，还要参与过程研究，进行现场指导，从课题的立项论证、开题指导、过程的管理、结题、推广都由相应学科教研员参与。学科教研员负责课题过程程管理的制度，把学科教研视导和科研视导结合起来，把教研活动和课题研究、成果推广结合起来，从而保证课题研究阶段的实效性，避免研究过程的盲目性，也为课题研究成果的提炼与推广运用找到一条切实可行的途径。
“分流”即指结题鉴定，不符合要求的降级结题，或者暂缓结题、不予结题。根据课题研究的情况，结题验收分为会议验收和通讯验收。B区教研机构制作了《各类课题结题资料初检表》，内容包括开、结题资料、过程资料、成果资料、整改意见、初检结论五方面，严把结题关。发现课题研究成果超预期，就建议由通讯结题变为会议结题，发挥会议鉴定对课题成果的推广作用。发现课题过程研究资料缺乏、研究报告简单、成果不充分的，建议暂缓结题。每年召开一次课题研究成果交流展示会，把各级各类获奖成果向全区学校推广。
“三分管理模式”细化了课题管理，将目标和责任统一，将学校和区级部门的职能统一，将各种积极因素整合，极大地提高了课题研究的执行力和影响力。