（一）评价方法与内容单一
平时成绩的构成包括哪些内容，不同高校、不同课程、不同教师等，在对平时成绩的构成方面并没有完全统一的限定。目前的评价方法与内容主要包括出勤、作业、笔记、平时测验、课题回答问题、完成报告及汇报等，但多数教师进行平时成绩评价时包含的项目指标单一，或某项指标的占比大，或某项作业的次数少、样本量小而产生量化不合理现象，对学生综合能力的考查不全，不能反映学生的特长、特点，对学生平时成绩的评价产生偏颇。
（二）评价尺度随意
平时成绩评价过程中，如何对学生的作业进行有效评价，从而产生有效的平时成绩是平时成绩评价的难题。在评判过程中，经常存在评判尺度随意、不规范现象。平时成绩评价工作量繁重、时间成本高，有的教师碍于工作繁重，不关注学生作业的完成度，仅以是否上交作为评价尺度。或在评价过程中对某项指标以优、良、中、及格、不及格的作为评价尺度，这样的尺度分数级差大，未能反映同一级别指标成绩的差异。
（三）评价程序不透明
因为成绩与奖学金、报送研究生等挂钩，很多学生很在意自己的成绩，学生如果知道如何能获得较好的平时成绩，对提升学习质量作用明显。但很多学生抱怨平时成绩评价不透明，不知道平时努力方向。“事前不说明，事中不公示、事后不备查” ，是很多课程平时成绩评价的问题，很多教师在学生考试结束后才给定平时成绩，用平时成绩平衡考试成绩，作为最后期末成绩评价的调整砝码。甚至参照期末考试成绩给出对等或接近的平时成绩，这种对照式的评价方式，背离了平时成绩评价的初衷，自然更不可取。
上述是平时成绩评价中常见的问题，实际教学中还有很多负面个案，均影响着平时成绩评价的科学性、合理性及公正性。