临床型研究生科研创新能力的培养，不仅是学生自己的工作方式需要从单一的临床转变为临床和科研相结合、齐头并进的形势，而且导师更应该适应这一培养方式，改进培养计划和培养模式。临床型研究生基础课程学习结束之后，首先在临床各科室进行实习轮转，掌握临床实践的基础知识和基本技能。由于临床工作的繁杂和琐碎，临床型研究生常常感到临床都力不从心，更无暇顾及科研工作。那么，临床型研究生究竟应该如何卸掉临床技能的训练和科研创新能力的培养呢？目前少部分学院已开始为每一位临床型研究生配备指导其科研工作的科研型第二导师，一般由专职科研人员担任该职责，通过第二导师来监督和指导学生的科研工作，引导学生科研思路的启发；同时让研究生参与到科研标书的撰写中来，把临床和科研有机的结合到一起，也可以提高学生写作能力，拓展科研思维，通过这种方式，可以极大增强了学生科研创新的信心，训练学生的科研创新思维，让学生受益终身。
临床型研究生的研究方向应该在导师的指导下尽早明确。目前，研究生主要存在两大问题：第一，找不到研究方向；第二，为了能够顺利毕业而匆匆选题。因此，在引导研究生明确研究方向上，导师应该“放手不放线”，在放手让学生独立选择研究方向的同时，做好引导工作并严格把关。我们的经验是要有效激励和引导研究生在理论创新的基础上更好地选题，并严格要求学生在第一学年必须大量阅读本学科领域文献，各发表1篇中英文综述文章。其次，导师要不断引导研究生培养自己的兴趣爱好，在本教研室科研大方向的基础上根据研究生个人兴趣尽早帮助其选择并确立研究方向，同时，注意兼顾学生的兴趣、研究本身的意义及可供探索的空间。