1文化融入不深入，未能充分展示深厚的医药文化底蕴
特色小镇因产业和文化而“特”。 文化因其深厚的底蕴、丰富的内涵、深刻的人文精神为特色小镇提供源源不断的持续发展的精神动力。只有产业兴，文运兴，特色小镇才会兴。所以说，特色小镇不能没有了文化!文化是特色小镇的“根”和“魂”。建设特色小镇不能断了文化的“根”，失了文化的“魂”。少了文化内涵的特色小镇，只具备“形”的外壳和躯体，而缺少了“神”的灵魂与实质，必将离特色小镇愈行愈远！
就蕲春县而言，还有许多重要且颇具地方特色的中药文化项目尚未成功申请为非遗项目,如蕲药谜语、蕲药生产民俗、蕲艾端午节、捕蕲蛇者小调、蕲蛇舞、蕲药膳制作工艺、蕲蛇炮制技术等。与李时珍医药文化相关的非遗项目不多,还有些颇具地方特色的项目没有能成功申请为非遗项目，未能充分展示作为传统中医药文化之乡的优势与魅力。
2产业发展形式和培育品种单一，产业具有不稳定性
产业发展形式和培育品种单一，产业发展形式方面，以单一的发展加工形式为主，未形成一定规模，也未形成强大产业支柱。种植培育品种也比较单一，易受市场需求和供给影响，呈现一定风险性和波动性。单一的产业发展形式、单一的种植品种，加之规模经济尚未形成，专业合作社之间彼此缺乏紧密联系，使得产业易受市场需求的影响，产业呈现一定风险性和不稳定性。
3.生产加工领域一枝独秀，未形成强大的产业集群
以该县中药材生产加工的龙头企业李时珍医药集团为例，该集团在蕲春县中药产业中可谓是一枝独秀，但主要是单一的加工生产，未形成百花齐放的行业融合发展趋势，未形成强大的产业群。生产加工企业不仅数量较少，且规模小，大规模的中药企业集群尚未形成，很难满足多样化的市场需求，这也限制了一体化中药产业的协调发展。