1、提高研究生自身科研素养
提高研究生毕业论文质量，根源在于提高研究生的自身科研素养。中医药院校在培养研究生过程中，应当将科研能力训练作为研究生培养环节中重要一环。研究生应加强文献的阅读，定期整理、汇报文献精髓，与导师、同学交流分享；鼓励研究生参与学术会议，了解科学前沿动态，开拓眼界；重视对研究生文献检索、科研软件应用、论文写作规范的培训。
2、建立导师指导论文评教系统
导师是研究生论文质量控制的首要关卡，必须建立完善的导师指导论文评教系统。一是建立导师分阶检查、全程管理论文的质控体系，形成早、中、晚期分时段考察，导师须全程参与。二是建立导师单一指导与集体指导相结合的模式，跨学科、跨学院建立论文写作指导小组，从选题、开题、中期检查、答辩等各个环节对研究生毕业论文进行指导。最后，将研究生毕业论文指导纳入导师考核标准，若出现论文抽检重复率超过30％、预答辩及盲评不予通过等情况，直接减少导师下一届招生人数，取消导师本年度评奖评优资格，并纳入导师绩效管控，从而提高导师对研究生论文指导的责任心，加强对研究生的论文全程指导、跟进。
3、建立分类别、分层次“双盲”评审机制
论文评审严格实施“双盲”评阅制度。一是注重论文分类盲送，应按学科、专业、研究方向分类别报送盲评专家，根据评审专家研究方向与研究基础，将临床研究论文与基础研究论文分别报送盲审，获得最公正、最专业的评审。二是建立硕士论文分层次评审制度、建立送审专家库。分层次评审分为学院抽审和学科送审，如学院按比例随机抽审，将抽审论文送往相关学位点的高校学位办，委托学位办送审相关学科专家；学科建立送审专家库，严格把控送审专家选择关，学科送审评议后，学院再随机抽审。三是加强盲审专家评审权，研究生需对盲审专家提出的问题作出相应修缮，并在文中予以体现，修缮后论文电子版反馈至盲审专家，专家审阅通过后，方可参加答辩，从评审专家层面提高对研究生毕业论文质量的管控。