高校协同育人参与主体涵盖了学校各职能部门和各基层单位，其中高校党建是高校协同育人过程中覆盖面最为广泛、最为重要的平台之一。高校党建工作一般由学校党委组织部和基层二级单位党组织负责管理，其中二级单位党组织即为基层党建参与主体。基层党建是高校党建工作的着力点和“神经末梢”，是高校协同育人工作成果的集中展现。因此，以高校基层党建为触点，开展协同育人工作，才能更好地推动高校整体党建工作的协同育人功能。
1.高校基层党建为协同育人工作提供思想保证和精神支撑
高校是为社会培养、输送人才的重要教育阵地，在高校治理现代化进程中要牢固树立“四个意识”，坚持“四个自信”。坚定马克思主义在意识形态领域的指导地位，坚持社会主义核心价值观。发挥党在思想引领和凝聚共识的强大功能，使党始终成为高校治理现代化的核心领导力量，从思想层面保证高校治理现代化的顺利实现。
高校党建是贯穿在高校现代化治理过程始终的政治任务。高校党建工作在高校育人建设工作中发挥着重要的政治引领和思想引领作用。基层党建是高校党建工作的基本着力点，党的一切建设工作都依托于基层党组织的建设。加强基层党建政治思想引领工作，可以筑牢高校主流思想建设领地，确保高校在坚持社会主义办学方向的问题上，能够始终保持正确的政治导向、价值导向和行为导向。加强基层党建政治思想引领工作，可以不断强化以理想信念教育、爱国教育为核心的国情、党情教育，教育，引导青年大学生建立良好的道德品质，树立家国情怀，把个人理想和国家梦想、个人价值与国家前途命运结合起来，坚定地为实现中华民族伟大复兴的中国梦而不懈奋斗。因此，思想育人是高校基层党建工作的首要任务，亦为协同育人提供思想保证和精神支撑。
2.高校基层党建是协同育人工作的重要途径
习近平总书记在党的十九大报告中明确指出:党的政治建设是党的根本性建设，决定党的建设方向和效果。高校治理现代化是国家治理现代化的有机组成部分，党在高校治理现代化进程中是核心领导力量，充分发挥基层党组织协同育人功能既是高校治理能力现代化的题中之义，也是推进高校治理能力现代化实现的必然要求。
基层党建是稳固基层意识形态安全的重要举措。加强高校基层党组织建设可以更加主动地占领高校主流意识形态阵地，为协同育人开辟重要途径。一是推进“两学一做”学习教育的常态化和制度化，加强对基层党员的教育培训；二是严格党的组织生活，坚持“三会一课”制度，突出基层党组织的教育、管理、监督、服务职能；三是严格执行党的纪律，及时消除一切侵蚀党的健康肌体的病毒。通过对党员的政治理念、政治立场、政治纪律的宣传教育，提升党员的政治站位和政治自觉，树立先进典型，正确加以引导，以党员带动周围群众，实现以点带面，以少带全的局势，最终达到凝聚政治共识，明确政治方向，实现政治目标的效果。
3.高校基层党建为协同育人提供内在动力
内生动力是促进事物可持续发展的重要支撑。积极健康的内生动力是保持基层党建工作良好势头的重要来源。随着改革步伐的推进，高校治理现代化治理难度增大，治理阻力增加。政治领导是从根本上破除一切治理阻力的最根本保证。政治建设是强化政治领导，提高政治能力，坚定政治信念，强化组织纪律性，实现服从组织、服从上级、服从多数的目的，以此教育和引导广大党员干部和党员教师站在讲政治高度，从思想和行为上服务高校改革发展大局，为高校治理现代化提供内生动力，使高校治理现代化顺利推进。