（一）三区联动机制及领域差别较大
社区教育面向不同的地域、针对不同的人群、选择不同的教学方法，实现不同的目标。其范围广泛，是一个综合类教育系统。社区教育的理想状态是汇集社会各方资源完美契合，通过整合各类教育力量，形成教育合力，提高教育水平。现阶段，我国社区教育发展呈现出“东部沿海地区高速发展，中部平原地区茁壮成长，西部偏远地区缓慢前行”的态势。在一些“三四线城市”尤其是偏远地区，社区教育还没有引起政府等相关部门的重视，百姓街道、社区、小区物业层面，高校、园区、民间组织等社会机构参与程度较低，并未形成社区教育发展联动机制。而且，作为三种不同形态的社会组织，校区、园区、社区各自在文化、制度、理念上存在着较大的差异性，这也给三方的合作带来了一些弊端。往往，在三区开展合作共建的时候，因受困于专业领域、体制机制、人才层级等问题，很多地区往往面临不知如何分工、职责如何权衡等问题，这也在一定程度上给三区联动发展带来了困难。
（二）三区现有社区教育专业人才员匮乏
社区教育作为近些年来发展的新型教育模块，其发展基础还较为薄弱，学科分类及课程体系构建还处于比较初级的阶段。很多高校社区教育专业也是近些年才刚刚设置，还属于比较“冷门”的专业，这就造成了真正懂社区教育发展理念的专业人才特别是顶层设置方面的“操盘手”比较匮乏。另外，由于校区、园区、社区三区工作人员岗位不同，专业领域差别较大，这也一定程度上给社区教育工作的合作带来了一定的专业上的困难。另外，由于社区教育涉及面广、服务人群杂、课程难度参差不齐，很多教育内容是比较“接地气”、“大众化”、“碎片化”的内容，这就容易给人造成一种社区教育起点较低、授课内容专业化程度不高、门槛偏低的错误观念。这就要求参与项目建设的校区、园区、社区三区从本地区当下对社区教育的现实需求出发，结合从事社区教育工作者队伍人员的实际状况对当前社区教育工作者专业能力进行强化培训，提高思想认识，加强专业化服务水平。虽然终身教育及全民学习的的理念近些年来在不断地普及、发展。但不可否认的事实是，我国社区教育跟欧美发达国家相比目前还只是处于起步阶段。而专业人才的发展又是各行各业深耕持续的基础，因此，对于社区教育工作者专业化水平的提升将是一个长期的努力过程，不仅需要不断的理论创新，更需要多维度的深层次研究。
（三）社区教育法律保障机制不完善
国家各项工作的开展和运行都离不开法律层面的支持和保障，社区教育亦是如此[4]。因受困于起步较晚，社区教育目前在我国相关的一些政策文件还不够完善，地方性的法律法规标准又层次不齐，不够统一。这就使得三区在合作共建的过程中难免会遇到一些法务层面上的问题。首先，关于社区教育与高校的合作条款，在法律层面上就还处于“空白”状态，还没有一个法律条文或是政策文件明确划定高校与社区合作各自的责任和权利。其次，高校与园区的合作往往仅仅局限于校企、校政层面的合作，其中多以高校科研扶持、政策理论指导为主的合作伙伴关系。从以往的实践经验上来看，高校与园区的合作并没有涉及到太多法律层面上的划分，更没有涉足到社区教育领域的深度合作共建。最后，园区作为一定区域的管理、宏观调控部门，往往发挥着“指挥官”、“裁判员”的功能，很多上层设计层面上的工作都是由园区规划部门负责统筹安排，具体任务由下属社区进行落实。这种“上下级”的关系使得园区与社区之间的合作容易产生错误的实施路径，造成内部动机偏离等问题。