（一）机构教材不统一
E机构没有固定的教材，也没有教学目标。每个教师都是先熟悉既有教材之后，根据当天的情况选择上课内容。在机构的书柜里，有很多专业的幼儿美术教育书籍，也有关于幼儿身心成长的书籍。教师不会事先准备教案，必须提前自己将所有知识消化完全。这样做存在的问题就是：教学过程前后没有连贯性，不利于系统的知识体系的建立。由于教材不统一，教学进程全由教师本人把握，如果教师中途辞职，会造成幼儿接续的教学内容混乱。人员的流失是在所难免的，不统一的教材加大了人员流失给机构带来的损失。而机构对此，并没有相关的应对措施。
（二）新教师难以培养
不以教材为依据进行教学活动，导致教学活动受教师主观影响大。教师质量决定了教学质量。E机构目前只有两位教师是从机构创办开始到现在一直在的，两位教师经验丰富，相对比其他老师来说，可以更好地胜任E机构的课程模式。但是，新教师往往缺乏实践经验，也没有经过系统的培训。对幼儿的了解程度也没有两位有经验的教师强，新教师会影响到课程的效果。至于培养新教师，创始人没有相关的系统的计划。目前，新教师能做的就是跟着老教师做助理的工作。
（三）无教学评价体系
由于没有明确的教学目标，该机构也没有成体系的评价方法。教师无法准确把握住幼儿的学习进度，家长也无法准确直观地感受到幼儿的学习状况。由于不成体系，整个教学呈现分散的状态。尽管艺术评价是主观的，但是我们仍然可以从各个角度出发对幼儿的表现进行评价，评价体系的建立迫在眉睫。
（四）家长认可度不高
从研究者对创始人和家长的采访来看，创始人没有去大规模宣传自身理念，经营模式类似于“姜太公钓鱼”式。家长方面对E机构的教学模式认可度不高，甚至存在质疑。主要有两种原因:一种是部分家长没有正确的教育理念，还停留在旧的教育观念上，支持以“范画”为主的旧式教育方法。第二种是部分家长即使拥有科学的教育理念，但是在E机构不够完善、没有系统的评价体系的情况下，依旧选择成熟的拥有完善体系的机构。