（一）课程目标设计具有随意性
思政课在高校属于公共理论课程，相对于专业课，公共理论课历来就不受教师和学生的重视。一方面，思政课的常规课程学生中学阶段就有接触，学生的求知欲没有特别彰显，对课程的关注度不高，认同感不强。另一方面，教师没有明确思政课的深远意义，再加上思想政治理论学科在高校，特别是一些专科性比较强的学校，历来都是弱势学科和专业，课程的设置仅仅是为了完成教育部下达的教学大纲设置的要求，学校没有给予应有的足够重视。这些都使得任课教师在课程设计的时候没有充分的积极性，也因为没有严格的课程目标，课程的设计根据教师的教育背景以及知识层次来自主确定，随意性比较大。同时，受传统教学模式的影响，教师照本宣科、按教材章节设计课程教学，满足于完成课时数，“灌输式”教学。学生也只是为了应付考试，死记硬背，拿到学分，没有学习的主动性和积极性，从而没有真正帮助青年学生树立正确的世界观、人生观和价值观，没有达到从理论和思想的高度去立德树人的良好效果。
由于长期以来教学目标过于单一，缺乏从多个维度去增加学生的内在认同，仅从面上引导。弱化了学科支撑，没有把思想政治教育作为一个完整的学科去阐释和研究，仅作为学生教育的辅助手段，因而缺乏有力的研究人员、研究团队和成果上的创新发展。因为教学目标定位不准确不全面，在老师满足于完成课时，学生满足于拿到学分的传统背景下，教学质量得不到保证，学生的学习局限于课堂，实践教学不规范，也缺乏为了达到某个教学效果而整体设计实践教学内容，教学体系不完整，教学要求不明确，没有统一的教学标准，教学安排偶然性和随意性较大。作为效果评价的教学质量评价的随意性表现的更为明显，把学生考试后的成绩评定作为教学质量和学生学习效果评价的重要和唯一手段，没有达到从真正意义上提升大学生的思想和行为的作用。
（二）教学实施过程缺乏系统性
“教学过程通常是指学校或教师、学生为了实现一定的教学目标而进行的各种教学活动前后相继的程序化活动过程。”目前全国上下对高校思政课在进行一系列的尝试，但是传统的教学过程设计和运行还是主流，教学过程中教师仍然是主宰，学生仍旧是处于被动接受地位。即使一些教师在教学活动中根据不同学科不同专业学生特点引入一些社会热点和现实问题，但这仍然是占课程的很少一部分。课堂教学缺乏实践教学环节，没有重视学生主体性的地位。不深入调研学生的思想状态和实际需求，没有选择从学生关注和关心的问题出发设计教学内容，难以引起学生的参与意识和思想共鸣。没有把政治认同、家国情怀、道德修养、法治意识、文化素养为重点，系统开展马克思主义理论教育，系统进行中国特色社会主义和中国梦教育、社会主义核心价值观教育、法治教育、劳动教育、心理健康教育、中华优秀传统文化教育。