1银行间业务联系较少，业务范围较局限
大型商业银行的资源优势集中于信用质量较好的核心企业，服务范围通常在核心企业及上下游的第一圈和第二圈。相反，中小型银行近年来不断致力于服务小微企业并取得了一定成果，但由于规模和资金的限制，业务模式还有待成熟。大小银行的客群差异及较为独立的业务发展模式，使得行业整体发展不均，业务范围还不能遍及小微企业。在2020年2月银保监会举行的通气会上，相关负责人曾指出，目前全国约有小微企业及个体工商户12000万户，商业银行对其的贷款覆盖率仅为20%左右，说明数量上占主导的小微企业尚未被有效的供应链金融服务所惠及，大小银行在拓展业务范围，发展业务模式方面缺乏合作。
2风控体系尚不健全
供应链金融虽然是一种自偿性的贸易融资方式，但其参与主体多、融资程序复杂，风险防范要考虑整条链的各个环节。常见的供应链金融风险有：核心企业及上下游企业的信用风险、贸易背景真实性风险、操作风险、物流监管方风险等。目前，对于信用风险，大部分银行尚未建立专门的信用评估体系和数据搜集分析系统；面对操作风险，主要依靠人力去线下监督和执行；对于贸易背景真实性风险，还缺乏有效的识别方法，伪供应链金融事件频发。当前我国正处于经济下行期，加上疫情的影响，即使是以往表现不错的风控机制也不能完全抵御目前的高风险，银行现有的风控体系还有很大的完善空间。
3业务模式仍需完善
目前，国际供应链金融的主要业务模式有应收账款贴现、经销商融资、装运前融资、BPO等八大类，几乎涵盖了企业产业链上的各个环节。而我国目前只有四种基本业务模式，其中应收账款融资模式的比例为83.1%，说明商业银行能够提供的业务模式较为单一，提供的服务远不及企业的贷款需求。此外，商业银行还缺乏行业定制化服务。供应链金融业务惠及的行业领域中，物流及大宗领域占据大部分比例，近年来快消品、农业、绿色环保和餐饮类非传统领域也开始逐步引入，但总体涉及供应链金融服务的程度不深。
4金融科技应用深度有待加深
随着供应链金融智慧化和数字化的业务要求，金融科技需要逐渐应用到风险控制、数据分析、效率提升、成本降低等各个方面。比如风险控制上，目前商业银行主要采用传统手段，面临着信息广度不够、深度不足、频率不高等问题，而引入大数据与AI技术将会很好地进行改善；在效率提升方面，多维度信息的收集与分析、对交易单据真实性的核验登记、对应收账款等动产的高频监控这些内容耗费了较多人力与时效，若能利用物联网、云计算、区块链等技术实现智能仓储及监控，电子合同签章等手段，会大大节省银行的成本，提高运营效率。