1.管理者自身角色定位模糊。
虽然现今高校管理者逐渐趋于年轻化，但仍有一部分资历老的管理者处在重要位置，他们富有经验但管理理念落后，年轻管理者多承担基础工作，他们更加灵活但缺乏工作经验。管理结构内部间、管理者与被管理者间都存在年龄层次的差异性，这会导致对学生的管理和引导工作存在困难，使管理者对自己的定位不明确。加之高校更倾向于培养复合型的管理人才，导致高校管理者任务艰巨，既要承担管理工作又要承担一部分教学工作，管理方面、尤其是心理辅导方面的专业度很难拔高，加深了其角色定位的模糊性。管理不仅包括各项具体事项流程的把控，在整个过程中更要关注学生的心理问题，及时解决学生的心理障碍，帮会学生树立正确的三观，这样才更有助于学生走进社会。
2.当代大学生个性鲜明，管理难度加大。
新一批“00后”大学生，从小就接触手机、电脑等信息化产品，受成长环境的影响，他们接触的信息内容五花八门，质量层次不齐，对其三观的形成有着潜移默化的影响。这导致他们的思想更开放更敏感，对待事物有自己的看法，处理事情有自己的习惯，这无疑加大了高校的管理难度。尤其是对一些资历老的辅导员，他们与“00后”存在着加大的代沟，在管理中更倾向于命令和指挥而非劝导和指引，这无疑会加重学生的叛逆心理，使得管理的效果适得其反。
3.大数据技术在高校学生管理中的应用范围有待拓展。
现今，大数据技术发展的如日中天，广泛应用于数据、金融、互联网等领域。但介于大数据技术使用的高难度性，必须以海量数据为基础，以强大的信息技术为支持，而高校缺乏相应的数据分析人才和配套的硬件设施，这使得目前高校的大数据分析技术多是在尝试和理论阶段，并未得到合理利用，亟需进一步的发展和利用，从而更好的解决高校学生管理中的难题。