新设专业通常在部队具有较强的需求，但新设专业人才培养体系还处于不断的完善与发展之中，人才培养能力相对薄弱。传统的任职培训思路与做法建立在成熟的院校教育基础上，新设专业由于本身还处于探索与发展的阶段，它在教学对象、教学目标、教学形式包括教学人员配置上必然与成熟专业的任职培训方式有较大的区别，已有的经验和做法并不能很好地适应新设专业的任职培训，为新设专业的任职培训带来了不小的挑战与问题。
（一）培养方案需进一步完善与优化
新开设专业是根据军队适应新形势下强军目标建设需求，结合部队新型职能与任务而设立的新型专业，其中不乏由相关专业整合与调整而形成的专业。相对来说专业知识点多，知识模块跨度大，体系不够完善。在生长干部培养体系还在不断健全完善的前提下，培养时间相对较短的任职培训更是存在着不小的困难。由于缺乏经验，培养方案的制定存在套用院校教学思路的情况，存在“大而全”的问题。在实际实施过程中又难以将所有知识点都包含在内，无法实现知识点的全覆盖。实际上多数基础知识对于受训人员而言也并非必要，大水漫灌的教学思路既浪费了宝贵的培训时间，还达不到预想的培训效果，最终导致学员对专业内容掌握不深、重点没有突破，培训效果不明显。
（二）参训人员专业基础存在差异
新专业的属性特点，决定了部队在该方面人才的匮乏，专业力量大都由不同部门、不同专业的人员抽调组成，其中只有部分人员原先从事相关专业，不少人员则完全面临一个新的专业。任职培训受训人员专业基础水平参差不齐，在受训过程中个人接受能力有着不小的差异，对教学活动的开展造成了不小的困难。另外，由于参加培训的人员来自不同的岗位，受训的目的与诉求也有所不同。例如在培养过程中发现，机关与基层人员对培养的需求就有不少的差异，机关人员更多注重理论的运用，而基础作业单位人员则更关心实践操作与技术问题的解决。因此，如何合理地协调与满足新设专业人员的各类受训目的与需求，是任职培训办学过程中需要积极解决的问题。
（三）培训内容与培训需求相脱节
通过调研摸底获知，能否解决作战训练实际问题是参训人员在任职培训中最为关注的问题，绝大多数受训人员把提高岗位专业能力作为参加任职培训的直接目的和第一需求。然而在新设专业任职培训中，一个突出的问题是培训设置的课程与部队实际需求存在着不一致。新设专业在部队处于快速发展的状态，知识观点更新速度快，技术体系变化节奏快，不仅对部队受训人员，而且对培训教学人员也提出了非常高的要求。院校在组织任职培训培训过程中，对新设专业的整体把握与了解较成熟专业还存在较大差距，对于部队的需求与基本情况掌握也不够全面，不可避免地造成了培训的内容与方式与部队实际需求不相适应的情况。
（四）预测反馈机制不健全
新开设专业任职培训，需要密切关注部队发展战略规划与发展前沿，掌握军队发展改革的现状及趋势，并有效预测人才需求，才能实现任职培训的整体效益。但在目前的形势下，一方面，新设专业的教学规律与能力生成规律还处于研究探索阶段，并未完全掌握，调研也难于了解掌握部队的全部需求，难于有效地对培养内容与规模进行预测；另一方面，院校的任职培训的培养计划往往由上级机关主导与组织，这种模式在执行与保障过程中具有优势，但常常又缺乏弹性与可调整性。这样就造成新设专业任职培训的培养计划存在一定的盲目性，在受训规模、时间安排、教学内容等方面与实际需求存在着一定的差异。