随着经济高速发展，社会对创新型人才需求非常迫切，然而“产学研合作”创新型人才培养面临一些困难，较大程度地制约人才培养的效果。
（一）缺乏协同的创新型人才培养模式
在经济转型的大背景下，制约许多产业发展的瓶颈是创新型人才缺乏。一直以来，人才培养依靠学校，但目前高校人才培养方案专业细分、专业化特色明显，存在明显的弊端，过分的专业化培养和专业细分，牺牲了人才的复合性和学科的交叉性。从企业需求看，更需要集成型跨界创新的复合型人才，这恰是当前人才培养的薄弱环节。与社会需求结合不紧密，使得学生知识视野狭隘有限，分析与解决问题的能力差，学校和社会各部门未形成协同育人的培养机制，阻碍了创新型人才培养。
（二）教学与科研发展不平衡
高校的基本职能是科研与教学。许多高校不能及时更新教学内容，与社会需求脱节严重，缺少工程实践能力方面的内容，大部分高校未能建立起创新创业活动与风投基金、企业创客空间的对接，不利于创新创业活动的持续发展。随着科技发展，对人才科研能力有了更高的要求，然而，这些教学内容与当前的技术发展趋势脱节，缺乏对学科前沿的关注，导致培养的人才科研能力缺乏。制约创新型人才培养突出的问题是科研与教学发展的失衡。因此，应完善人才培养机制，加强教学与科研融合，协调好两者关系，实现创新型人才培养。
（三）合作主体诉求分歧明显，利益分配机制不完善
从目前状况来看，一些地区拥有优质的教学资源、较高的教学水平，而一些地区则相对落后，希望能借助于人才协同培养，提升自身办学水平。教育发展的差距造成了利益格局障碍，需要政府进行顶层设计层面指导，还需要协调院校和企业之间的利益分配关系，高校注重传播知识与学术研究，而企业更看重的商业价值[6]。在校企协同培养人才过程中，一方面，企业通常抱怨学校的专业设置与社会的需求结合不紧密；在提供实习基地时，企业需要向学生支付工资，但实际中，一些学生的能力并不能满足岗位的要求，给企业造成资金浪费。另一方面，高校抱怨学生被当作廉价劳动力，在实习过程中没有话语权。
（四）高校缺乏创新文化氛围。
纵观我国很多高校培养的人才，缺乏独立思考能力、创新思维和批判精神，原因是不重视创新文化建设，缺少创新文化氛围熏陶，创新成果较少。因此，高校应通过开设创新文化课程，设立创新文化基金，大力宣传创新文化，营造浓厚的创新文化氛围，使学生在创新中感受到乐趣，培养学生的创新精神和科学素养，逐步成为适应社会需求的创新型人才。