1、领导重视度不够造成的资金管理风险
当前许多事业单位没有建立完善的财务管理制度和内控体系，这其实和单位领导对财务的重视程度不足有着直接关系，部分事业单位的领导不了解财务工作的重要性，认为财务部门只是属于后勤保障的一部分，就是发工资报销的部门，缺少现代财务管理理念。由于领导既不熟悉财经纪律，也不对资金的管理和审批权限进行认真规范，使得单位的财务制度管理流于行事，造成很大的资金安全漏洞。
2、财务人员素质不够造成的资金防控风险
财务人员是货币资金管理的核心力量，当前事业单位的很多财务队伍却处于青黄不接的状态，许多老财务人员管理观念落后，工作经常还停留在传统模式上，无法应对新形式下的资金风险，而新参加工作的财务人员又缺少相应的风险防控经验。
3、现金、银行业务管控不严造成的资金安全风险
现金收支手续的不完善和保管制度的不健全是容易引发现金风险的最大原因。随着互联网的快速发展以及公务卡的普及，现阶段事业单位现金流量已经大为减少，但某些基层单位或是特定部门仍然会产生较多的现金流，例如某些单位的食堂账户、党费账户等。而库存现金管理也由于一些单位财务监管的不健全，容易存在公款私存、收款和票据金额不一致、坐支现金等违法违纪现象。
银行业务存在的漏洞主要表现在：（1）签取空白支票，盗取国有资金，将公款取出或转入私人账户。（2）涂改账单，掩盖事实，使其与银行存款日记账上的金额相符，以掩盖银行存款减少的事实。（2）（3）网银密钥管理不善造成的资金安全风险。
4、审批制度不健全造成资金滥用及违规风险
由于各单位内控建设的程度不同，审批过程中经常遇到懂财务的没有权限审批，有审批权限的却不懂得财务的尴尬境地。而一些单位的财务人员利用审批制度的漏洞，在领导不知情或不了解真实用途的情况下，私自开支没有得到授权的资金，或者在办理业务时不遵循财经制度流程，这些违规行为不但使单位资金的安全性和规范性面临极大的风险，同时也容易产生贪腐的问题。
