1、医护工作者对党建工作的思想认识存在偏差。
医院在发展的过程中存在党建工作游离于医院中心工作之外，党建思想政治工作与医务人员的专业发展两张皮的问题，很多支部党员工作对于党建政治思想认识不足，将党建工作与医疗器械、医生专业技术水平作比较，认为党建工作是空中楼阁，属于没有业绩的虚无缥缈工作，由此带来的缺乏对党建工作的兴趣和热情，对于支部开展的活动参与的积极性不高。
2、党建思想政治工作开展的内容枯燥、形式单一。
党建政治思想工作缺乏创新。目前医院的党组织中存在的活动形式较为单一，拘泥于阅读原著和照读PPT层面，党建工作内容相对枯燥，与时代脱离的现象较为严重，缺乏强有力的吸引力，并没有达到实际意义。总的来说，党建政治思想工作也还停留在较为传统的工作模式中，在体制与机制上都严重缺乏创新观念和意识。
3、党建工作监督管理方面存在差距。
党建思想政治工作要想使其不流于表面真正发挥应有的作用，需要各党支部制定明确的工作原则和科学的工作方法，加强对日常党建活动的监督管理，定期抽查。目前有些临床一线的党支部书记对自己的角色定位认识模糊，履职尽责不到位，在党支部日常管理工作中没有深入基层进行调查研究、解决党支部建设中面临的具体问题。工作中习惯于出思路、作决策，将党建工作甩手给支部委员干。对个别党员职责不到位、工作滞后、绩效较差等问题，仅限于批评教育，包容多、问责少，存在好人主义、监督不够、问责不严。考核约束乏力，对党员违反纪律行为往往是刀子高高举起，轻轻放下，下行传导压力不够。
4、党建思想政治工作缺乏专业的人才队伍。
党建工作有效开展的关键一环在于高素质的党建干部队伍的培养。党建干部队伍的素质水平直接影响党组织的作用发挥情况，由于经费和人员编制等因素的影响，医院党务干部一般都是由从业人员中挑选，缺乏系统理论的指导，对党建工作的视野有较强的局限性，很难体现出党建干部队伍的综合素养和先进性，缺乏钉钉子精神和功成不必在我的情怀做实做细各项党建思想政治工作，直接影响了党建工作的开展效果。