随着国家“五位一体”评估工作的开展，国内高校纷纷加大力度推进内部质量保障体系建设。经过对相关高校大量的调研和分析发现，部分高校在质量管理、质量改进以及质量文化建设等方面取得了一定的成绩，但是，对照新一轮审核评估的新要求，内部质量保障体系建设还普遍存在如下突出问题：
1.新质量观尚未牢固树立。根据质量保障工作实践，高校内部质量管理可以分为经验管理、制度管理和文化管理三个阶段，当前国内高校质量管理更多地处于第一阶段或第二阶段，高校质量管理工作更多地基于教学管理人员对质量保障工作的感性认识和自身工作经验。新时代教育质量观尚未牢固树立，“学生中心、产出导向、持续改进”的质量理念没有贯彻落实，内部质量保障工作的开展缺乏科学性和持续性。
2.质量标准不健全不规范。当前部分高校的质量标准不健全不规范，主要表现在：一是没有根据专业特点制定多样化的质量标准；二是没有覆盖人才培养的全部环节，只针对专业和课程等制定标准，课堂理论教学、实践教学、毕业设计（论文）、学生学业成就等主要教学环节的质量标准缺失；三是把规章制度当作标准，且标准表述不规范、不明确，不可操作。
3.质量评估尚未全面开展。当前部分高校内部质量评估工作尚未全面开展，在专业评估、课程评估方面加大了力度，取得了一定的成效，但是在院部评估、课堂理论教学、实践教学、毕业设计（论文）、学生学业成就等主要教学环节的评估比较薄弱。
4.持续改进机制尚未建立。目前部分高校质量持续改进机制尚未建立，主要表现在：一是持续改进制度不完善，相关单位的质量职责不明确，工作难以有效开展；二是教学过程质量监控机制、毕业要求达成情况评价机制、毕业生跟踪反馈及社会评价机制没有建立起来，未形成“监控、评价、反馈和改进”的闭环系统，难以保障毕业要求和培养目标的有效达成。
5.质量监控与评估信息化平台未建立。目前很多高校信息化手段落后，对互联网、大数据、人工智能等先进信息技术手段应用不到位，尚未建立内部质量监控与评估的信息化平台，质量监控与评估工作无法高效开展；相关人员的数据管理和数据思维能力不足，专业技能有待提升，严重影响了内部质量保障体系的有效运行。