1 开工时间晚以及开工比例低
疫情发生以来，休闲农庄、农家乐停止营业将近半年，原本应迎来客流高峰的春节黄金周和春游踏青受到影响，“五一”期间游客又限流，所有企业都有不同程度的经济损失。1-6月份是疫情最严峻的时候，所以当时休闲农业开工比例很低，而7-9月份国内疫情相对来说被控制住了，所以开工比例有了大幅度增长，10-12月份疫情常态化使得美丽休闲乡村开工比例更高。从规模来看，小型休闲农业企业的抗风险能力较弱，经营收入骤降导致资金链紧张，企业生存遇到较大挑战，有破产、倒闭风险；中大型休闲农业企业，涉及的领域往往较多，且拥有现代化的经营管理方式，抗风险能力相对较强，所受影响相对较小。从经营内容来看，拥有农业种植、加工等产业的企业，因为有农业产业支撑，短期客流量减少带来的影响相对较小；而对以休闲观光为主、农业产业薄弱的企业来说，这次疫情带来的损失更为惨重。
2联农带农作用短期内减弱
由于疫情影响，北京市美丽休闲乡村的农民就业人数下降。今年1-6月份相比去年1-6月份，农民工从业人数大幅下降，今年7-12月份相比去年7-12月份来说，农民工用工人数大概持平，但总体来说疫情使得美丽休闲乡村的联农带农作用减弱。 一方面，原本在企业就业的农民面临着暂时的失业，失去了部分收入来源；另一方面，一些企业原本带动附近农户发展相应的农业产业、农家乐等，也会受到较大影响。另外，2020年是打赢脱贫攻坚战的收官之年，很多休闲农业企业都有对口帮扶的贫困户或是带动贫困户就业的，由于受疫情影响可能会带来返贫风险。
3行业投资信心受挫
这两年对于休闲农业行业来说，尤为艰难。休闲农业的投资量这两年的差距很大，说明疫情对使得休闲农业行业的信心受挫。很多企业还没从“大棚房”整治的影响中走出来，2020年一场突如其来的疫情更是使得美丽休闲乡村的发展雪上加霜，将近半年的停业，春节和各种假期应该是休闲农业发展的黄金时期，但是在疫情的影响下，美丽休闲乡村显得格外的死气沉沉，一些小规模和资本的经营主体经受不住巨大的打击而被迫退出这个行业，而一些试图进入这个行业的主体而又打消了这种念头，所以，这场突如其来的疫情也使得经营主体的发展信心大受打击。对于投资者来说，面对损失，发展信心受挫；而那些有意愿投资休闲农业的投资者，可能会持观望态度。