1. 高职学生自主学习性不强
据蓝墨云班课教学功能显示：《毛泽东思想和中国特色社会理论体系概论》混合式教学课程中，教师通过云班课平台向全体学生发出统一通知，但课后讨论、留言互动信息很少。由此可以看出大学生虽然喜欢线上学习模式，但自主学习的效果并不理想。主要原因是跟高职院校很大一部分学生的自主学习习惯不好，学习的自觉性不够等等。
2. 教师教学工作量增加
据云班课教学功能显示：《毛泽东思想和中国特色社会理论体系概论》混合式教学课程中，普通教师周学时12，教给6个大班级近 460 名学生授课。教师加强云班课教学平台的成员管理、讨论区指导，头脑风暴评分，作业评分批改，课前预习内容发布、设计等，同时要完成面授内容的教学设计准备。这给任课教师带来了更大的教学压力
3. 教学资源拓展和挖掘不足
目前，教育资源开发还在不断探索阶段，对学生兴趣点和思维点把握也在持续更新，混合式教育资源开发已经初见成效，但还未能充分挖掘学生的真实需求导向，同时混合式教育资源结构需要进一步整合扩张，整合与思政课相关知识链接、推荐导读、练习等，扩张是要做到学科跨界。
4. 教师对载体使用熟练度不高
由于思政课理论传授和价值引领等方面的特殊性，即使在 “互联网+教育”兴盛的今天，仍有部分高职思政课教师因为对信息化技术使用党不熟悉、不重视，难以改变原来传统课堂党授课模式，敷衍对待现在党混合式教学模式，没有积极党学习和培训，导致部分教师对载体使用熟练度不高。
5. 教学载体应用形式不一
部分高职院校对思政教学载体的应用还没有系统化、体系化、制度化，涉及面只是部分学生，载体的形式不够丰富，只是思政课的实践活动或是思政公众号等，教学载体的设计也只是学校的思政专任教师。很多学校对于这些已有的教学载体也没有能够有效的落实开展，或是宣传力度不够，普及面有限。
6. 高职院校重视程度不一
部分高职院校的管理层存在理念问题，对推进混合式教学模式改革的重视程度不够，对如何进行顶层设计、如何协同推进、如何保证效果等系列问题缺少必要研究和论证。由于管理层的重视程度的不同及建设经费问题，导致网络、平台等软硬件设施建设各校的差距较大；部分高职院校信息技术应用、管理与服务队伍建设也未得到足够的重视，特别是高职院校基层单位相关服务人员能力不足，不能更好地做好信息化支持服务工作。
