常见的财务管控模式一般分成集权、分权和混合型，不同的管控模式都存在利弊。鉴于历史原因、监管松紧、市场环境等因素影响，不同国有企业财务管控各有差异。但整体来看，目前国有集团化公司财务管控模式普遍有一定局限性，具体可以概况为以下四点。
一是分类管理实施难，财务管控效率低。集团化公司下属企业类型众多，包括公众公司（上市公司、三板公司）、全资子公司、混合所有制公司等。虽然对不同类型公司财务管控有一定差异，但真正分类管理实施难度较大，这其中的原因包括制度细化程度不够、管控人手不足、历史惯性等。另外，普遍存在对全资和绝对控股企业管控过多问题，导致下属企业财务安排缺乏灵活性。这就导致财务控股效率偏低。
二是业财融合程度低，财务价值提升少。目前国有企业财务管控仍以事后财务核算、分析为主。多元化集团公司业务种类较多，财务管控中未对不同生产经营、业务流程深入了解，在事前筹划及过程参与不足情况下，会对下属企业发展状况认识不足，导致业财融合较低。财务数据无法精细化分析，并业务环节相结合，导致财务数据价值未充分体现。
三是信息化应用不足，全面管控能力低。标准化简单重复工作仍未实现财务信息系统自动化处理，不仅使日常财务人员大量时间精力耗费其中，而且数据准确性和及时性不足，制约财务管控效率。此外，集团公司和下属企业存在未打通财务系统，集团公司无法实时直接获取下属企业财务数据，增加了报表合并、预算管理、资产管理等实时管控的难度。
四是下属企业融资弱，整体资金效率低。集团公司充当最主要融资主体，下属企业通过集团借款等满足经营需求，融资能力被弱化。集团公司对下属企业资金管控太强，不同行业下属企业融资能力各不相同，集团公司统一内部借款利率定价，市场化程度不足，制约集团公司对下属企业的优胜劣汰及新兴优质企业的扶持。