1.实验室安全意识淡薄。（1）微生物安全意识差。在科研实验室中，进实验室不穿白大褂、不戴手套做实验、戴手套触摸门把手、将实验垃圾当成生活垃圾随意丢弃等现象常有发生，还存在直接将食品带进实验室食用的现象。（2）危险化学品、危险废弃物安全意识差。对易燃易爆及易制毒危化品、毒麻药品认识不到位，储存、使用方法不当，例如：用矿泉水瓶盛放酒精；使用后的危废随意倾倒等。（3）仪器设备使用的安全意识差。仪器操作不按操作规程使用，特别是一些特种设备，例如：高压灭菌锅、烘箱过夜工作，高速离心机、酒精灯使用时无人看管等。
2.实验技术人员配置不合理。（1）精密仪器缺少专业的仪器管理、操作人员。科研实验室拥有大量精密仪器，而实际管理的技术人员数量不足，导致一名实验技术人员同时管理多台仪器，从而无法精而细的掌握仪器的操作，无法准确、及时的掌握仪器的使用状态，无法及时对存在故障的仪器设备进行及时的保养与维护。（2）实验室缺少专职的试剂耗材管理人员。科研实验室中各个课题组自行采购试剂耗材，造成了试剂耗材的重复购买和浪费。（3）实验室缺少专职的实验室运行经费及课题经费管理人员。高校教师教学、科研任务繁重，不能合理使用经费，报账不及时，存在经费的实际支出与经费预算存在很大偏差，影响课题结题。
3.仪器设备管理不到位。（1）仪器设备共享程度低，使用率低。各高校间，甚至各实验室间仪器设备的重复购买，高校间仪器设备的共享低等，导致仪器设备使用率低下。（2）仪器检测的原始数据存储不当。科研实验室日常运行中产生的数据和信息数量非常庞大，但是却缺少有效的信息存储系统来保证数据和信息的有效存储。