湖州科技创新驱动发展模式目前仍以政府主导为主，因此在发挥市场主体例如企业创新、政策支持等方面尚需完善。通过对京沪粤苏四省市科技创新驱动发展模式深入分析和对比，湖州与上述地区创新经济相比，无论发展规模或者机制与效率上都存在较大差异，具体体现以下四方面的差异上：

1.驱动要素差异分析
深入对比就会发现，京沪粤苏四省市驱动科技创新的主要要素-政府、企业以及科研机构之间呈现极强的互补性。因为京沪粤苏四省市主要以市场主导为前提，政府推动科研驱动科技创新。这种模式下，企业通常具有较强的产业导向性，企业积极与国内外相关企业、大学以及研究机构进行合作，促进科技、服务和产品的创新，使其专注应用性研究；与此同时，政府并未彻底退出研发活动，而是转而专注基础科学研究，以及为产业进行前瞻性预测、制定产业发展战略性计划；高校及科研机构积极与国际一流名校和研究机构进行合作，为科技创新不断补充智力资源。湖州更倾向于制定相关政策驱动科技创新，虽然市场主体的创新潜力得到有效激发，但存在政府职能定位模糊的问题；此外，湖州科研机构在开展公共性、基础性以及战略性的科研或者技术研发上，与国外机构院校合作较少；湖州企业应用型研发的导向亟需增强。
2.产业聚集差异分析
通过不同驱动力的叠加影响，京沪粤苏四省市市场主导模式下形成的产业集聚，来自于企业自身内在动力，主要表现为地区集聚化、分工专业化、制造规模化以及组织架构小型化的有效组合，作为跨领域跨专业的自发的选择性集聚，在其行业内部具有高密集度集聚的特征。湖州政府主导模式下形成的产业集聚，主要是由政府利用多种优惠政策措施吸引外来投资的结果，这样形成的产业集群，较少来自中小科技企业自发形成的集聚。且湖州产业聚集还受到地方行政区域划分影响，面临未发育成熟的相关产业聚集得不到有力扶持等问题，从而阻碍湖州产业聚集的进一步壮大。

3.环境建设差异分析
总体来看，京沪粤苏四省市科技创新环境建设侧重于为创新企业提供和优化人文、政策、经济以及法治环境，为创业个体提供完善的创业创新以及环境。湖州科技创新环境建设则更多为科技型中小企业提供开放式的投融资环境，注重为区域产业集群完善创新环境服务，但是在基础创新环境建设上投入不足。湖州对大学生创新创业方面的宣传引导教育尚未到位，虽然大学生对于创业优惠政策非常熟悉，但具体的支持手段例如从哪些方面支持，如何获取这些支持等相关细节却知之甚少。根据调查结果，多数已经创业的大学生都是通过自身具备的技术以及项目选择创业方向，很少有人是按照相关创业优惠政策进行选择。