1、传统审计成本高效率低
在传统现场审计中，项目组成员需要现场与被审计单位管理层进行沟通，查看和收集相关资料，实施的审计程序较多且需要项目组成员做相应的测算和底稿的编制。人力成本和时间成本投入较高，尤其是当被审计单位距离较远或在国外的情况下更是加大了差旅费的支出。传统审计存在工作量大、周期长的特点，具有繁琐的审计步骤，审计程序以及底稿分析程序实质性程序的编制工作量大，耗时较长。同时，目前审计过程仍需要依赖大量纸质凭证，查看耗时、保管不方便，需要项目组成员投入较多的时间和精力，造成整个审计过程周期长效率低。
2、传统审计风险高
传统现场审计是对企业根据其发生的经济活动编制的财务信息进行监督和审查，由于企业商业活动的日益频繁和复杂，在抽样审计的基础上并不能对企业发生的财务信息的真实性和合法性做出完全符合事实的客观评价。况且，由于存在利益冲突，上市公司财务报表造假，对会计记录和会计账簿进行篡改，并且会计操纵方式越来越隐蔽，使企业存在较多的虚假会计行为，给投资人带来了巨大的经济损失。而目前审计工作主要是抽样审计模式，抽样风险由此产生，审计质量主要取决于审计师的专业综合能力。当被审计单位存在财务造假行为时，被审计单位财务人员会极力避免审计人员发现真相，可以说被审计单位和审计人员打起了一场游击战。对于被审计单位存在的舞弊造假行为自然是隐瞒不报的，一方面尽力避免审计人员发现，另一方面又做好周旋的准备。经常是当审计人员发现线索时企业财务人员也就变得不太配合，甚至是找理由消失，使审计人员的工作难度不断加大。
3、数据可靠性无法保证
在一些落后地区传统手工帐目前仍然存在，对于手工帐来说，凭证和附件具有被替换和删除的可能性且不被发现，当企业发现错误或漏洞的时候可以临时补上一些依据来证明会计事项的真实性。对于目前存在最多的联网审计来说企业的财务数据存放在一个数据库当中。这些数据都是有关企业经营的财务信息，对于企业来说很重要，对于数据的保密性要求很高。然而，数据库可能会遭受到来自网络病毒的攻击或一些恶意破坏由此造成严重后果。数据库数据是形成于企业财务信息，企业有权对数据进行修改，相对于纸质数据，电子数据被篡改后被发现的概率更低。当企业为达到相关的财务指标和效益指标的时候就会产生修改财务数据库数据的动机。而审计人员由此可见，数据信息的可靠性无法完全保证。
