高校基层党组织是以院（系）为单位设立的党的基层委员会，是党的基层组织的重要组成部分，也是各大高校人才培养、学科建设、科学研究、教学管理、服务社会的政治核心力量，主要扮演着以下2个方面的角色：
（一）中国特色社会主义教育事业发展的支持者、宣传者与执行者
办好我国高等教育，必须坚持党的领导，牢牢掌握党对高校工作的领导权，使高校成为坚持党的领导的坚强阵地。高校基层党组织深入基层、贴近师生，是高校党建工作的基础和重要参与者，是教学、科研、学生管理等工作向基层延伸的着力点，承担着宣传党的主张、贯彻党的决定、领导基层治理、团结动员群众、推动改革发展的重要职责。高校基层党组织在党委领导下的校长负责制的组织架构中具有承上启下的重要作用，对上要认真学习和领会中央党委、省市党委、高校党委的路线方针政策，积极贯彻落实各项决策决议，对下肩负着引领师生思想、传播科学文化知识、塑造时代新青年的重要任务。一方面，高校基层党组织始终围绕在党中央周围，始终以党的中心工作为出发点和落脚点，立足正确的政治立场、明确政治责任、强化政治引领，确保我国高等教育朝着社会主义的方向不断前进与发展。另一方面，高校基层党组织秉持着“四为服务”原则，及时根据上级党委要求调整自身的工作重心与目标，结合教育发展规律和时代发展背景，创新体制机制，改进工作方式，通过学习、讲座、参观、交流等党日活动将党的思想路线、方针政策、精神面貌传达给广大师生，加强党员队伍建设和管理，提升党组织的凝聚力和战斗力，努力使每一个师生党员都能够在党爱党、在党言党、在党为党。
（二）高校思想政治教育工作的引领者、服务者和监督者
高校思想政治工作关系高校培养什么人、怎样培养人以及为谁培养人这个根本问题，要把思想政治工作贯穿教育教学全过程。学生思想政治工作与党建工作是高校党委的重要工作，开展学生思想政治工作，是党领导高校的具体体现，也是开展高校党的建设的重要抓手。首先，高校基层党组织是高校最基本、最下沉的党组织形式，离师生最近、影响也最直接具体，是思想政治工作的核心主体，能够有效抓住意识形态的主导权、主动权和话语权，在高校规划、学科建设、科研管理、学生教学等方面把好“政治关”；善于遵循高等教育的发展规律，将党的建设工作与师生的思想政治教育合二为一，易于构建“你中有我，我中有你”的融合机制，促进党的路线、方针、政策以及上级党组织的各项决定指示落实到实处实地，用思想武装头脑，内化于心，外化于行。其次，基层党组织肩负着“发展党员、管理党员、教育党员”的重要职责，一个人只有思想上入了党，才能将其考虑为组织上入党的积极分子，而每一个人的思想都是在不断塑造与纠正中上升前进的，青少年时期更是如此。基层党组织的性质和地位就是一种无声无形的思想教育，通过培养和教育师生群众，选拔一批优秀的人员进入党组织，吸引更多的群众围绕在党组织周围，为思想政治教育奠定基础，继而成为高校思想政治教育的重要抓手。