高校思政教育受到各级领导重视，也已取得一定成果，其开放的思政课堂指导思想明确，课程资源丰富，教学也有一定特色，但还存在一些不足之处。
（一）师资队伍参差不齐
师资队伍中有事业心强、责任感重的，也有因循守旧、固步自封的。部分教师将教育关注点过多地放在理论知识的强调上，弱化了对于学习和教育的感性认识，导致学生对职业规划和未来发展缺乏系统认知；在课程目标及课程达成度设计中关注教学知识点的设计，弱化了思想意识的启发和思考，一些学生学习多为应付考试，没有入心入脑；在学期考核中过分重视卷面成绩，忽视了对学生思想品德的考察，思政教育仅停留在理论层面，学生缺乏相关实践经验。
（二）教学方法陈旧保守，教学理念更新不够
思政课程开设基本到位，但高校的思政教育过于理论化、教条化，灌输式、被动“填鸭式”的课堂教育无法取得预期效果。教改后虽然“填鸭式”教学现象得到一定改善，课堂设计增加了师生的交流环节，也出现了经典阅读法、专题讨论法、案例教学法、学生授课法、社会调查法等一系列新型课堂模式，收到了一定效果但仍存在明显的“知识型”课堂现象，学生的注意力仍旧集中在掌握知识点而没有学会如何自主学习，没有改变被动接受教师指令的习惯。教材体系并没有很好的转化为课程教学体系，知识体系也没有预期地转变为德育信仰体系。
（三）学生的德育理念意识不够，学习兴趣不高
不同学科、不同专业的学生思维方式、政治理论基础和学习自主性存在较大差异，就思政课程来说，工科学生的理论基础及课程重视度明显低于文科学生，且不同专业学生的理论基础参差不齐。高校扩招背景下专业就业对口职业岗位减少，部分学生认为此类课程与其自身实际关联不大，对升学及就业创业的帮助有限，故学生的思政理论课学习兴趣不高，学习积极性较差。教师在开展课程教育时要依实际情况把握好问题设计的深浅，充分尊重学生的思维方式和性格特点，实施更具针对性的教学互动。针对理论基础较薄弱的工科学生，开展导学互动课堂时在问题的设置上可以相对浅一些，便于前期知识点的导入，鼓励采取辩论的小组方式调动学生的自主学习性，促进思维模式和学习主动性的养成。