由于菲律宾被美国殖民统治近半个多世纪之久，菲律宾整个国家在多个方面都在一定程度上继承了美国的制度，在菲律宾高等教育方面就可以看到，菲律宾的高等教育制度主要是继承并延续了美国高等教育制度，学校的高等教育方面并不是由单一的政府部门监管，而是由政府的不同部门来负责监督管理。菲律宾政府长期以往在高等教育方面都保持着高度重视的态度并施以实际行动，为了更好的发展菲律宾本国的高等教育，菲律宾政府不断向教育相关部门投资数千亿比索，这不仅仅是投资在教育方面，还投资在了扶贫项目上，菲律宾政府大力扶持贫困学生，专门为贫困学生设立了助学资金项目，以此来资助他们完成高等教育。据现有数据统计，与2015年相比较，近5年来，菲律宾全国大学毕业生数量增加了8万人，菲律宾全国大学生入学人数增加了68万人，菲律宾全国高校数量增加了221所。
菲律宾政府为了更好地发展本国的高等教育事业，成立了专门机构，其主要职能是负责所有有关于高等教育的事务——高等教育机构，该委员会独立于整个教育部。高等教育委员会的成立，体现了菲律宾对本国高等教育的高度重视，此委员会是独立的，仅隶属于菲律宾总统，且由菲律宾总统直接任命高等教育委员会的委员与主席，并且还为更好的管理高等教育专门出台了相关的法律法规，每年都必须开展有关于高等教育计划和政策调整的会议且会议次数不得少于一次，每年都必须开展是为了确保所制定出来的计划、政策能够与时俱进并且适应当代社会发展，使得高等教育制度不会落后，保持一定高度的发展。
同时菲律宾还拥有独立的高等教育质量认证体系，是独立于高等教育委员会的菲律宾国家认证协会（Federation of Accrediting Association of the Philippines, FAAP）。FAAP由四个评估和认证不同类型高等教育机构的机构组成:菲律宾学校、学院、大学认证协会(PAASCU)，菲律宾教会学校、学院、大学认证协会(ACSCU-AA)，菲律宾学院以及大学协会认证委员会(PACU-COA)， 菲律宾特许学院以及大学认证协会(AACCUP)。前三个机构对不同类别的私立高等教育院校和大学进行认证，最后一个针对公立院校和大学进行认证。认证的对象包括特定课程或项目以及整个高等教育机构。具体课程或项目的认证需要从课程或项目的目标、教职员工、图书馆、实验室、学生指导、组织管理和学校社区等方面进行评估和认证。认证共分为四级，以第四级为最高，每一级别都有不同的标准。对高等教育机构的认证则在课程或项目认证的基础上对整个机构进行全面的评估认证，只有获得第三级认证以及大部分项目都获得认证的高等教育机构才有资格获得FAAP的认证。