1 思想观念传统，新技术接受度不高
目前，随着农村农业结构调整和社会经济的发展，农民现有的传统生产方式和生产技术，已经远远不能适应新农村建设的需要，极大地阻碍了农业现代化的进程。因此，农民对科技的正确认识以及新技术的掌握，是决定农业科技入户顺利推进和实现农业现代化的重要因素之一。
根据调研结果显示，有66.95%的农户的受教育水平在“小学及以下”，这表明农户自身的知识水平较低。一方面导致农户科技意识的缺乏或对科技的认识十分局限，另一方面也导致部分有强烈意向采用新科技的农民客观上很难掌握农业技术，心有余而力不足。此外，部分农户“等、靠、要”的思想依旧严重。究其根源在于农户的内生动力不足，缺少受教育的主动性，这就限制了农户对农业科技知识的学习能力以及接受动力。
2. 南疆地区科技入户资金缺乏，限制技术推广
南疆农村地区科技入户发展虽然得到了较多的资金支持，但这些资金对于相对落后的南疆地区远远不够，资金问题依然是一个较大的问题，限制了技术推广。一方面很多农户缺乏科技资金，不仅打压了农民学习新技术知识的积极性，而且使农业技术推广成为“口号”，即使农民对新技术较为渴望，也无法将新技术应用到农业生产上。另一方面对科技推广人员的资金支持力度不够，没有解决科技人员的后顾之忧，造成只是为了推广而推广，而不是切合实际的积极主动地帮助农民接受新知识、新科技、新事物、新成果，久而久之会导致科技入户在农民心中可有可无。
3 农机装备相对落后，机械化水平低下
近年来，南疆的机械水平得到了显著提高。但是，不能忽视南疆地区机械化水平起点低、装备落后的现状。南疆地区现有的农机装备中，大多都是价格较为低廉，使用方法传统、单一的农业机具。这些农机具的工作质量和效率低下，而对于大型的机械设备，大多数农民都不能接受其昂贵的价格和复杂的操作程序。由于南疆地区的农民接受知识的能力相对有限，对先进的农业机械认识不足，在使用和推广过程中，很多农户不能快速的接受机械的新功能，在农业机械购买过程中也持观望态度，很少购买新的农业机械设备。因此，农户只能人工作业或者使用效率低下的农机作业。此外，农民对购买农机补贴了解程度不够，也在某种程度上阻碍了农业的机械化发展。