（1）没有搭建有效的协同创新平台。物流专业是伴随着我国物流业的快速发展而设置的一门涵盖信息科学，计算机科学，管理科学，经济科学等多门学科的交叉学科，也是一门注重应用的应用性学科，所以实践与学科交叉的协同创新平台对于创新型物流人才的培养至关重要。通过整合高校，相关企业以及研究机构的优势资源进行互补，搭建以高校为主体的协同创新平台，如联合实验室，设备共享平台，信息交互平台等达到在人才培养中的多家联动，是进行创新型物流人才培养的重要途经。然而大部分高校如今仍然局限于以高校为单一主体的人才培养模式，学校与相关企业，科研机构并未形成较为系统的对学生进行培养的模式，造成学生只是在校被动的接收知识，缺乏主观能动性，无法将所学知识联系到实际当中从而导致创新能力缺乏。部分高校虽然存在着一定的协同创新模式，但其模式是不全面的，说其不全面并不是因为其结构的不全面，而是制度的不全面，各个创新主体并不认真落实并履行自己的责任与义务，只是根据教学培养方案简单走个过场，做做表面功夫，只有其表，未有其里，既浪费了学生的时间以及大量教学资源，学生也没有实际的学到东西。协同创新平台搭建好之后，在校内教师要尽力以其专业的知识对学生多做引导，在校外各个创新主体内，应该让学生切实结合自己所学的知识进行一定的学科实践，让学生在实践的过程中，通过发现问题，解决问题，将自己学到的学科知识融会贯通。同时，在实践过程中应让学生多多接触学科前沿的知识与技术。只有这样才能开阔学生的视野，让学生明确本专业的发展现状以及前景，激发学生对科学研究的兴趣以及主动进行学术探索的欲望。使学生能够在实践中充分发挥自己所学的理论知识，逐渐提升学生的动手实践能力以及创新能力，
（2）科学研究与教学相脱节。教学与科研是高校的两大职责，虽然听起来二者有着很多不同的内容，但却存在着密不可分的关系。首先教学是科研的基础，通过教学一方面让学生掌握学科的基本知识，提高学生的专业素养，这是进行科研的基础；另一方面教学可以促进老师与学生思想的碰撞从而推进科学研究实践。其次，科学研究能够促进教学水平的提高，科学研究是学生掌握一直学科知识之后结合实际的需求进行探索的过程，在这个过程中，老师通过提供循序渐进的引导，让学生遇到问题，自己思考，自己动手去解决。从而可以极大地提高学生的思考能力以及运用知识的能力，从而达到在课堂中达不到教学效果。但是实现有效的科教融合却并不容易，一方面随着国家对高校科研资助的力度越来越大，部分教师将工作重心转移到了科学研究，从而逐渐的忽略了教学这一本职工作，导致部分高校出现了“重科研，轻教育”的不良现象，降低了对人才培养的重视程度，另一方面，部分教师只专注于教学，不重视科学研究认为两者不可兼得。目前，在很大程度上，物流专业科学研究前沿知识仍没有融入到人才培养体系中去，教师在上课过程中根据每年不怎么变化的教材，教授学生学科的基础知识，殊不知在如今物流快速发展的今天，好多东西都已经不在适用于当前时代，教师在教学中没有将学科前沿的成果带入到课堂中，导致学生虽然掌握了大量的学科知识，但无法运用到实际当中，缺乏思考能力和创新能力，从而导致科研与教学脱节，这也是如今想要培养创新型物流人才亟待解决的问题。