1. 脱贫攻坚与乡村振兴衔接不到位，相互协调与融合尚未实现
目前，巩固拓展脱贫攻坚成果与乡村振兴刚刚开始衔接，整个衔接力度尚未到位。在此，不仅不能充分利用巩固拓展脱贫攻坚成果——农民收入与购买力的快速增长加快推进乡村振兴，而且乡村振兴的发展成果——产业发展及其经济增长也难以及时反哺于脱贫攻坚，快速增加就业岗位，彻底切断返贫致贫路径，加快脱贫攻坚成果的巩固与拓展。在多数农村地区，巩固拓展脱贫攻坚成果与乡村振兴齐头并进、相互协调与融合的目标尚未全面实现。
2. 乡村振兴战略刚刚起步，遏制返贫致贫的产业基础十分薄弱
产业振兴尤其是农村一二三产业的融合发展是扩大就业规模、增加农民收入、壮大农村经济、最终遏制返贫致贫及其实现共同富裕的重要保障，同时也是巩固拓展脱贫攻坚成果与乡村振兴有效衔接的物质基础与关键环节。但是，我国乡村振兴战略刚刚实施，农村产业发展还不理想，巩固拓展脱贫攻坚成果的经济基础十分薄弱。目前，由于农村经济相对落后，部分困难群体难以自我脱困，需要资金或就业扶持。在资金扶持方面，多数乡村基层组织财力不足，“造血功能”有限，产业发展必受影响。从整体上看，我国第一产业实力较弱、效益不高，第二、第三产业基础较差，竞争力不强，一二三产业尚未快速融合发展，就业渠道的拓展、就业率的提升、农民收入及其购买力的增长都受到了严重制约。显然，乡村振兴对脱贫攻坚的反哺与财力支持力度远未到位，遏制返贫致贫的产业基础还十分薄弱，巩固拓展脱贫攻坚成果还缺乏强大的经济后盾，在客观上影响了巩固拓展脱贫攻坚成果与乡村振兴的有效衔接。
3. 产业结构不完善，支撑力相对不足
近年来，虽然我国农村产业结构发生了巨大变化，二三产业得到了快速发展，但是，与发达国家及其乡村振兴的客观需要相比，产业结构的优化调整还不尽人意。目前，在广大农村尤其是落后地区，大部分农民仍还以种植业为主，不仅第一产业发展相对滞后，第二、第三产业竞争力不强，整个产业结构很不完善，而且，一二三产业融合进程相对迟缓，农产品深加工不足，附加值较小，缺少富有竞争力与带动力产业集群及其龙头企业，农村就业规模的扩大和农民收入的增长受到了严重影响。久而久之，巩固拓展脱贫攻坚成果与乡村振兴衔接的产业支撑力将会受到严重削弱。
4. 推动脱贫攻坚成果与乡村振兴衔接的融资难度较大
由于受到信息不对称、部分农业企业和大量农户的信用能力不高尤其是农村一二三产业“单打独斗”以及投资回报周期较长、资金回报率低、贷款回收风险大等因素的影响，不少银行、信用社等金融部门不愿轻易放贷，贷款难问题在农村多数地区较为普遍。同时，股票、债券等融资形式在农村地区也步履维艰，融资难度不言而喻。如果没有政府部门介入担保，一般企业或农户想如数贷款融资的确不易。尤其是在一些刚刚脱贫的地区，农民经济实力更为有限，融资成本更高，工商资本下乡难度更大，农村一二三产业的发展进程及其融合力度还很不理想，乡村振兴对脱贫攻坚成果巩固拓展的支持力度也难以快速提升。由此，脱贫攻坚成果的巩固拓展及其与乡村振兴战略有效衔接的难度将会进一步加大。