（一）体育社团重活动轻思想政治教育
从目前高校体育社团活动的开展情况来看，体育社团活动的组织，更加倾向于与体育相关的活动，这也是体育社团组织的根本目的和基本特点，体育活动的组织一方面可以满足学生的参与需求，另一方面也是增强社团凝聚力和向心力的有效途径。体育社团以社团成员的需求基础作为社团活动组织的出发点，形式多样的体育活动的组织，在开展过程中，侧重于体育活动本身的开展，以及体育活动所产生的氛围，而对思政内容的整合融入相对欠缺，在这种情况下，体育社团活动组织娱乐性质更为突出，思政教育功能实现存在一定的难度。
（二）体育社团注重自身发展，轻视思想政治教育的导向作用
体育社团组建的目的是为具有相同运动兴趣的学生，提供参与体育运动的平台，因此对于活动的组织开展，更加重视活动组织的参与效果，以及活动组织是否有利于体育社团自身的发展，而对体育社团思政教育功能的发挥则相对不足。从体育社团组织开展的角度来说，管理者在实践活动组织开展的过程中，依据发展需求对管理体制不断完善，制定具有长远性的发展规划，但是规划中对思政教育功能缺失。在体育社团自身发展过程中，缺乏对思政教育功能实现的引导，影响了体育社团思政教育功能的发挥。
（三）体育社团注重思想政治教育形式，忽视教育效果
在素质教育理念大力推行的教育背景下，越来越多的高校体育教育者和体育社团的组织者重视思政教育的重要性，并且会在体育社团活动组织的过程中，融入思政教育内容，例如组织社团文化节、拓展训练等活动形式，但是在具体的开展过程中，活动组织开展普遍停留在表面，未对思政教育内容进行深入的考虑，影响了思政教育功能的发挥。