高校开设围棋选修课在一定程度上可以辅助学校的心理健康教育工作。当然，在具体的实施中也会面临一系列的问题。
（一）高校对围棋的重视度不够
据不完全统计，目前国内开设围棋课程的大学大约有60多所，其中，复旦大学、四川大学、中央财经大学、上海外院、北京邮电大学、上海财经大学、中国石油大学、陕西师范大学还招收围棋特长生；复旦大学还成立了业余围棋学院。虽然围棋在一些高校受到了重视，但这些还远远不够。让全国高校真正重视起围棋，还有很长的一段路要走。目前大部分高校对学生参加围棋活动总体上是支持和认可的态度，但尚未制定相关的具体制度，即在实施层面缺乏相应的措施和具体的计划，学生也因此并没有感受到实质意义上对围棋学习的重视和支持。
（二）缺乏师资
当前开设围棋选修课的高校面临最大的问题就是没有专职的围棋教师。由于围棋课的特殊性，对教师本身也有着更高的要求。作为围棋教师，首先要会下围棋，其次要懂得教学艺术，最好具有较为深厚的人文功底，能从文化上、历史上甚至是艺术上全面地介绍围棋，站在哲学甚至多学科的视角去诠释围棋。这确实不是一般懂围棋的人能胜任的任务。当然作为高校教师不仅要具备基本的教师素养，还要热爱教育事业。
（三）缺乏科学的围棋课程体系
市场上关于年幼学生的围棋课程教育体系较为完善，由于高校开设围棋选修课的时间并不长，目前尚未形成较为成熟科学的围棋课程体系。从心理发展的视角而言，两个不同年龄阶段的群体，其身心发展特点不一，对内容的掌握和理解也各异。因此，针对高校大学生的身心发展特点和学习特性，结合高校培养人才的目标，制定科学合理的课程体系，显得尤为重要，这将是围棋的教育功能得到充分发挥的有力保障。
针对上述高校开设围棋选修课可能会面临的问题，首先需要高校领导高度重视围棋的教育意义，大力支持围棋的普及和发展，并制定相应的管理办法与细则等。在学校做大量的围棋宣传工作，联合高校的相关部门真正把围棋教育落实到大学生日常的教育体系中，配合学校的心理健康教育，充分发挥其强大的教育功能。其次，应注重师资培养，由于受到种种条件的制约，师资匮乏的局面短期之内很难得到根本的改观。因此，学校应根据自身的实际，采取走出去，请进来的方式，与当地所在的行政部门和围棋协会进行沟通、交流，请求给予相应的技术支持和帮助，如有合格的师资，可以聘请兼职教师。同时高校也可以有意识的培养自身的师资力量，让校内具备一定条件的教师外出学习，这在一定程度上可以解决师资匮乏的问题。最后，构建科学的围棋课程体系。要想发挥围棋课的教育功能，不仅要形成围棋基础课、提高课等相配套的课程体系。还要建立一个全方位的教育体系，即课堂教学、课外指导、活动辅导及实践培训于一体的完整的体系。围棋基础课主要针对围棋基础知识差的学生，引导大学生入门的基础训练。围棋提高课是具备一定的围棋基础知识后开设的课程，锻炼学生的逻辑推理能力和创造力。此外，也可以开设一些围棋知识与欣赏方面的选修课，如中国围棋发展史，围棋智慧在日常生活中的运用等等。由于围棋课程的特殊性，仅仅课堂教学是远远不够的，需要大量的课外实践指导，才能不断的增长棋艺。高校只有设置完善科学的围棋课程体系，才能充分发挥围棋对大学生的教育功能。
围棋是凝聚着中华民族高度智慧的文化，在高校开设围棋选修课一方面顺应了素质教育的潮流，另一方面给大学生提供了一个提高自身素质的机会。围棋是培养大学生良好的心理素质的有效途径之一，尤其在当前重视大学生心理健康教育的形势下，围棋以其独特的功能在高校心理健康教育中发挥着重要作用。与此同时，教育者应充分考虑到开设围棋选修课可能存在的问题，并采取积极有效的措施进行调节，使围棋真正能在高校心理健康素质教育中发挥积极的作用 。