人口增加、土壤条件恶化、气候变化和食品价格波动是影响非洲国家粮食安全的主要因素。提高农业生产率则是解决粮食安全问题的有效途径。围绕农业发展需求，开展战略性农业科学研究，建立高效的科研创新机制与农业科研体系，是提升农业生产率的重要条件。下文将从农业科研组织构建、农业科研资金投入、农业人才培养三个维度，具体分析东非三国农业科研体系建设状况。
（一）农业科研组织构建
东非三国在农业生产方面具有得天独厚的自然优势，但由于缺乏合理规划、技术落后、生产投入严重不足等方面原因，农业科技发展水平总体较为落后，亟需加强农业科技管理体系建设。农业研发的制度景观在不同的国家有很大的不同。大多数研究系统，特别是在大中型国家，都是高度复杂的，由国家农业研究所支撑，辅以其他一些政府、高等教育和非营利机构。
东非三国的农业科研组织机构中承担科研任务的主体包括政府、高校、非盈利机构和私营企业。总体上看，三个国家的农业研究主要由各个国家政府部门承担，但近年来随着高等教育的发展，高校在农业科技管理体系中的地位越来越重要。非盈利机构和私营企业在农业研发领域发挥的作用较为有限，但近年来表现出良好的增长潜力。三个国家在农业科研体系建设过程中普遍存在的问题主要包括：农业科研投入不足、高层次人才缺乏、农业科研创新机制缺乏等。
肯尼亚方面，肯尼亚的农业研究分别由政府四个部、高校、国际机构和私人企业承担。政府部门承担着肯尼亚农业研发主要任务。随着高校数量的增加，高等教育部门正发挥着越来越重要的作用。非盈利机构和私营企业在农业研发领域发挥的作用非常有限，但具有增长潜力。隶属于肯尼亚政府的农业家畜研究所（以下简称KALRO）是肯尼亚最重要的农业研发机构，其研发能力占据了整个国家农业研发能力的半壁江山，KALRO通过其遍布肯尼亚的研究中心从事研究和技术传播工作。2016年肯尼亚共有各类农业研究机构39个，其中政府研究机构5个，高等院校34个。2000-2016年间，肯尼亚的全职科研人员数量由888人增长到1,158人。肯尼亚的农业科研力量主要集中在政府研究机构层面，从人员分布情况上来看，各级政府研究机构人员占比为70%，其次是高校，占比25%，最后是各类非盈利组织约占比5%。
埃塞俄比亚方面，埃塞的农业研究系统由国家农业研究所、各州/区域农业研究中心、高等教育机构、非政府组织以及私营部门构成。埃塞俄比亚的农业研究由埃塞农业研究所（EIAR），地方农业研究所（RARIs）和高等教育机构（HLIs）承担。埃塞俄比亚农业部负责在联邦层面指导、构建和规范农业产业发展。在地方层面，各州的农业与农村发展局负责指导和支持农业发展。埃塞俄比亚近年来在建立农业研究体系方面取得了坚实进展，农业研究人员队伍持续扩大，全职科研人员的数量在2016年达到3000人，人员的增长均匀地分布在EIAR、RARIs以及高等教育机构。