曹本《山海經》共分四冊，均爲紙本，其中第一冊七十二幅，第二冊五十四幅，第三冊四十一幅，第四冊三十九幅；後有副頁五副。第四冊末幅有隸書款識：“至正乙巳東吳曹善書。”據此可知，曹本寫成時間是元至正廿五年，即1365年，抄成時間距尤袤本僅185年，是迄今能見到的最早《山海經》手抄本。該書第一冊末幅記：“崇禎戊寅四月宋獻同王毗翁觀於眉公古香亭院。”第一冊的第五幅、第二冊的第五十四幅、第三冊的首幅及四十一幅有“陳眉公書畫記”印；第一冊的第六幅、第三冊的第十八幅有“陳繼儒印”；第一冊的第六幅、二十幅、二十七幅，第二冊的第八幅，第三冊的第九幅，第四冊的第六、二十八幅、三十七幅有“眉公”印；第一冊的第五十一幅有“仲醇氏”印，第六幅有“夏之是季爵”印。第一冊第一幅又有“乾隆御覽之寶”、“嘉慶御覽之寶”、“養心殿鑑藏寶”、“三希堂精鑑璽”諸印，末幅有“太上皇帝之寶”、“宣統鑒賞”、“無逸齋精鑒璽”等印。第一冊副頁有董其昌書“山海經”三大字、“有賛”兩小字，董氏又識云：“元曹世良手抄，明姚公綬、王元美、陳眉公家藏，崇禎乙亥六月董其昌書。” 第四冊副頁有姚公綬篆書題跋，簡述曹善生平；又有王世貞題跋，闡述自己對《山海經》的一些看法；又有陳繼儒跋語。
該書無疑是“三性”俱足的古籍珍本，在當時已是珍寶，秘不示人。據以上款識、印章、題跋也能知道，該書前期藏於姚公綬、陳繼儒、董其昌等書畫名家手中，後輾轉入藏清宮，爲皇家所珍寶，常人無法得見。清亡以後，該書藏於故宮博物院；後又因政治原因，致使全書長期下落不明。種種原因，造成其文獻價值並未得到發掘和傳播，未對《山海經》校勘產生過影響。
曹本全書以小楷抄成，字跡整飭、秀勁超逸，是元代少有的書法精品，尤其該本抄寫較忠實于底本，較大程度上保存了底本原貌，從下面所舉例子大略可知。
第一：奇字照錄
如《中山首經》“牛首山”下云：“多飛魚，狀如鮒魚，可以已痔。”案“”字字書無，核對尤袤本、明《藏》本、明監本等，知“”字是“衕”字之譌。曹善既是飽學之士，書卷抄寫又十分整飭，而“”字左、中、右三部件皆譌，所以該字爲曹氏誤寫的可能性極小，蓋是底本已譌，曹善照舊抄錄所致。
又《海內經》：“九丘”下有“建木”：“百仞無枝，有九。”案，“”字書所無，對比宋本、《道藏》本可知，該字當是“欘”字之譌，大概也是曹善照原形錄下，並且該字字形一筆一劃，書寫十分工整。
又《北次二經》“諸餘之水”下云：“諸餘水出焉，東注水。” “敦頭山”下云：“其上多金、玉，無草木。水出焉。”案，“”即“旄”之譌俗字，《偏類碑別字·方部·旄字》引“齊高叡修佛寺碑”等有此字，此字極少在後世刊本中出現，即便在寫本時代也多在佛教文獻中出現，因此此字也應該是曹善照舊抄錄所致。曹本中存有大量俗字、異體字、譌俗字，均未改回正字，保留了較多《山海經》寫本時代的特色，限於篇幅，無法一一列舉。總之就用字情況來看，曹本較忠實於底本。
第二：殘損照錄
底本有殘損處，曹氏就殘損筆畫照錄，保持底本原貌。
如《北次三經》“軒轅山”下云：“鳥狀如梟，白首，名曰黃鳥，其鳴自[案，該字只餘“言”旁，右側位置空出，現以“”表示。]，食之不妬。”“”字殘，只餘左側“言”旁。案，依文例及《山海經》用字情況，此字可補爲“詨”或“䚯”，但曹氏照原本抄錄，並不妄意添補，甚爲嚴謹。
第三：缺字空出
從曹本抄寫情況來看，曹本所據底本稍有殘缺，但凡缺字處，曹氏即空出位置，以示有缺。這樣的例子較多，只略舉一例以作說明。
《海內經》“苗民”下云：“有人曰苗民。有神，人首，虵身，長如轅。”郭注云：“大如車轂，澤神也。”“澤”上缺字，曹本留出位置。而今本郭注作：“大如車轂，澤神也。”“澤”前空缺已無，不如曹本存舊。
第四：曹本中多處有標識符[案書中尚有朱筆標識，分別爲朱色豎綫、朱點、朱筆塗污等痕跡，偶有朱筆補字，如《南山經》末《圖贊》有“自若”，“自”旁有兩朱點，並以朱筆補“白”字，蓋爲收藏、閱覽者所爲。]
通覽全書，曹本中僅見三處塗污重寫，分別爲：《南山首經》祭山禮“毛用一璋玉瘞”下郭注引《周禮》：“陽祀用騂牲毛。”“騂”上有一字，用墨筆塗污，隱約可見“馬”旁，當是“騂”字誤書；《北次三經》“景山”下多“諸與”，郭注：“今江南單呼爲諸，音儲，語有輕重也。”“語”上有一字墨筆塗去，餘“言”旁依稀可見，當是“語”字誤書；《北次三經》“發鳩山”下有“精衛”鳥，“曰女娃”，郭注：“娃，要□反。”“娃”上一字未寫完，尚餘“”等筆畫可見，當是“娃”字誤寫。曹本塗污的例子目前只此三例，且都出現在第一卷，足見曹本抄寫之精。除此三例外，曹本數見“乙”、“卜”兩種標識，計有數十處之多。