第一，新媒体时代让高职院校意识形态的话语方式从单向变为双向。新媒体网络时代，信息传播具有开放性、自主性和隐蔽性的特点，这些特点在一定程度上使得高职院校话语权从单向变为双向，让一些恶性言论有了可乘之机。其一，有西方敌对势力利用社会热点做文章，故意歪曲社会敏感话题，引导舆论导向，诋毁社会主义思想，趁机破坏社会主义政权；其二，通过传播西方文学和影视作品，宣传西方的资本主义思想，威胁马克思主义在意识形态领域的领导权，严重影响当代大学生的价值观；其三，一些立场不坚定的网络喷子利用网络随意评论一些社会现象，企图站在道德的高度引导舆论走向，影响大学生的正常思维方式和价值判断。因此，如何利用互联网的优势所在，实现新媒体和主流意识形态引领的深度耦合，对高职院校新媒体工作者提出了挑战。
第二，新媒体时代让高校意识形态的话语权传播逐渐失控。大学生因为自身强烈的求知欲，对网络上的内容充满了好奇心，但是网络上的信息繁杂，一些不良信息混迹其中，筛选起来不容易，同时一些人为了引起大学生的关注，故意设置一些新奇的标题来吸引大学生，这些都导致了话语权传播逐渐失控，监管面临困难。不能从源头治理，经常都是出现问题以后才去管理，监管不及时导致了一些不良信息的快速蔓延，很难遏制住。因此，如何因势利导，净化网络空间，加强信息监管，用社会主义核心价值观抢占网络传播阵地的至高点，成为当前高职院校意识形态工作的重中之重。