1985年教育部、劳动人事部、财政部、总参谋部、总政治部、总后勤部六部委联合发布《关于高等院校、高级中学进行军事训练试点问题的通知》，国防教育试行进入普通高校，2002年，教育部、总参谋部、总政治部联合颁布《普通高等学校军事课教学大纲》，明确规定军事课程是普通高等学校本、专科学生的必修课，军事课由军事理论课程和军事技能训练两部分组成。总体讲，我国普通高校国防教育起步较晚，而且在实施过程中，存在重视程度不足、承训力量短缺、军地交流不畅、教学条件受限、师资队伍薄弱等现实问题，导致国防教育落实效果不佳并陷入停滞不前的困境。
（一）国防教育在义务教育中分量不足。罗援将军讲，“尚武精神就是生存精神”， 从世界大国尤其是军事强国的经验看，国防教育从小抓起是启发公民爱国爱家、崇尚强健自觉的关键一步，青少年早期的国防教育，其育人功能明显，国防教育作为素质教育，应该从孩童抓起来。由于高考“应试”教育，高考考的和高考不考的，“待遇泾渭分明”。国防教育在我国义务教育阶段所占分量不足，受重视程度不够，导致中小学校落实上质量参差不齐。到了大学阶段，本应该“恶补”，但受“考试过关”的惯性思维和“以就业为指导的实用主义”，大部分学生应付思想比较严重。近年来，军方在对新兵数质量情况进行检查调研时发现， 72%的新兵对军队和国防的初体验“来自电视报刊等大众媒体”，“来自学校教育”的仅占4%，反映出中、小学校对青少年国防教育的缺失缺位。
（二）国防教育在内容落实上“缺斤短两”。按照2002年颁布的《普通高等学校军事课教学大纲》，普通高校学生的军事课分为两个部分，一个是军事技能训练，一个是军事理论课。在军事技能训练中，大纲设置条令条例教育与训练、轻武器射击、战术、军事地形、综合训练等科目，但实际教学中，限于承训力量不足、训练场地受限、参训大学生数量偏大、体能素质总体偏弱、安全防范工作压力大、组织管理力量单薄等诸多原因，据统计大部分高校只能完成三大条令条例的训练，军事技能训练效果难以达到《大纲》目标。军事理论虽然作为必修课，但据统计全国普通高校只有不到三分之一的学校真正把军事理论课程作为必修课列入大学生人才培养方案中，建设专职教师队伍，按《大纲》要求列入教学计划中，还有近三分之一的学校根本没有开设军事理论课程。由于高校学生重视程度不够、大部分学生以“考试过关”为目的，军事理论课程实践环节少缺乏吸引力等多种原因，导致国防教育在落实中参差不齐，有的学校则重形式，走过场，影响了国防教育的深入发展。
（三）国防教育在方法创新上“因循守旧”。“ 一场战争异化一场战争”刘亚洲将军说，“战争是最富创新的艺术”。国防教育一定要把军事本身的魅力传达给受教育者，但受制于具体条件，军事技能训练和军事理论课程所规定的内容或本身已经陈旧落后于时代，或难以用直观感性的手段表达清楚。有的高校军事课程教学的思路仍然比较僵化，教学照本宣科、教材文案乏味过时、教育手段枯燥单一，使得教育难以入心入脑。有的高校所在地拥有作战部队、红色教育基地、传统军事教育资源等良好平台，但融合沟通不足，没有充分利用这一国防教育的生动载体。有的学校在组织军事理论课程授课时，过分依赖慕课教学、军事电影、纪录片等多媒体教学方式，趣味有余，内容不足，传授知识不成体系，使得国防教育的军事效益产出不理想。