爱国主义教育系统作为社会巨系统下的子系统，必然与社会系统的复杂性特点相联系。在当前的社会环境中，“政治、经济、艺术等社会文明的一切进步都是结构的改变，人类文明的进化就是不断增加和完善各种复杂社会系统的结构，从而使社会系统不断增加新功能的过程。”爱国主义教育系统既包含在社会巨系统之中，又不断完善社会巨系统的功能。爱国主义教育系统与自然生态系统相似，其内部在不断地自组织、自进化、自发展，同时还连续地与社会巨系统发生着互动。复杂性视域下，爱国主义教育系统具有开放性、非线性、整体性、以及有序性的特点。
（一）爱国主义教育系统具有开放性
“系统能够与环境进行交换的特性，叫作开放性……一般来说，一个系统（特别是生命、社会、思维系统）只有对环境开放，与环境相互作用，才能生存和发展。”换言之，如果系统对环境的开放不够，那么系统本身的生存与发展都会受到不良影响，严重时甚至会毁灭系统本身。就系统本身而言，开放并非意味着系统与环境的相互作用一定是互利共赢的，而是存在着一定风险的，说明开放是辩证的开放，是一分为二的开放。
钱学森认为，“社会系统中组分及分系统与外部环境交换信息，通过开放获取信息，不断进化。”这就意味着社会系统的开放性不仅在社会本身，而且存在于社会系统的所有组分。信息的交换与交流就是开放性的最直接表现。
爱国主义教育系统是社会系统下的子系统，自然具有开放性。当前的爱国主义教育系统外的社会环境表现出巨大复杂性，进而在开放性影响下，爱国主义教育系统本身的复杂性也大大增加。爱国主义教育系统在消化社会环境的影响时，丰富了爱国主义教育系统的内涵；同时，爱国主义教育系统本身对社会环境的影响，也将有利于社会系统内部的稳定、繁荣与发展。
（二）爱国主义教育系统具有非线性
非线性即线性的对立面。在简单性科学中，线性代表着某种对称性，某种均衡性，线性思维是近代经典科学兴起的基础。在线性思维的指导下，不论是在物理学、生物学这样的自然科学中，还是在哲学、社会学这样的人文社会科学中，学者们普遍认为事物的发展是可以通过安排和设计来实现的。然而，“复杂性科学揭示，世界从本质上讲是复杂的，线性的相互作用和规则简单的秩序乃是一种特例，而非定则。”即，所有事物的本质都是复杂的，都不能以简单的线性思维思考。
爱国主义教育系统内部涉及多个部分，既有教育者，受教育者，还有教育要素。爱国主义教育活动由这三个部分共同参与，因而在教育活动进行的过程中，每一个部分都有着非线性特征。教育者与受教育者在社会生活中的不同经历、在教学活动中的不同感受，教育要素在社会发展中的与时俱进、在教学活动中的差异运用，都带有非线性特征。在复杂性理论中，事物每一部分在发展过程中的不确定性，都将促成事物发展的偶然性与随机性。这些不确定因素最终使得事物的发展展现非线性特征。就爱国主义教育系统而言，在实施爱国主义教育的过程中，教育者难以保证每一受教育者都达成预设的教育目标，教育过程中的突发性事件，随机性发展，都会导致的教育结果的非线性呈现。
（三）爱国主义教育系统具有整体性
受简单性思维的影响，上个世纪的许多科学家热衷于将自然现象简化为机械运动，将自然中的每一部分当作构成机械的零件，从而理解其内部的运作，以发现“规律”，也就是还原方法。然而，就此思维来看，部分离开整体以后，也应当具有原本的作用，每个部分合在一起，就是“1+1=2”的效果。然而，“直到如今，当科学在研究不断变得更为复杂的过程和系统时，我们才认识到纯粹分析方法的局限性。”“在系统的诸多属性中，居第一位的是整体性……”复杂性理论认为，复杂系统内的每一部分之间都会发生相互作用，这个相互作用就是“涌现”，而正是因为相互作用，整体的特点才得以存在和显现。
爱国主义教育系统是一个具有整体性的社会子系统，在其内部，还有分支的更小系统共同运作。就爱国主义教育系统而言，还包括理论系统，领导系统，教育工作系统等。如若单独发展爱国主义教育系统的理论系统，那么研究出的理论将是不符合爱国主义教育工作实际的理论，是不配合爱国主义教育目标制定的理论。换言之，不论单独研究爱国主义教育系统中的任一子系统，都无法实现爱国主义教育系统的完整功能。但是，值得注意的是，在爱国主义教育系统中，“……会对部分加以约束，约束就是对部分进行限制和束缚……压抑各个部分的优点或属性。从这个意义上讲，整体小于部分之和。”在复杂性理论看来，整体性仍然具有复杂性。因此必须要辩证看待爱国主义教育系统的整体性特征。
（四）爱国主义教育系统具有有序性
有序是事物之间规则的相互联系，无序是事物之间不规则的相互联系，也就是说，有序与无序都是事物之间的相互联系。普利高津曾指出，“我们生活在一个可确定的概率世界，生命和物质在这个世界里沿时间方向不断演化……”这里所说的有序并不指的是完全的有序，而是蕴含着无序的有序。就比如在星系的运转中，地月系统的周期性运动也有非周期摄动，完备的法律系统也无法公正地解决所有违法行为；而看似杂乱无章的物体，比如一堆垃圾，内部也是各种垃圾相互挤压，相互支撑，有序地安置每一块垃圾。具体而言，系统的有序性主要体现在系统内组分的结构有序以及系统的运行有序。系统内组分就是组成系统的部分，在一个开放复杂巨系统中，有大量组分协调运作，使得整个系统内部运行及与外部其他系统之间交换物质、信息与能量。
爱国主义教育系统的有序性首先体现在教育对象上。爱国主义教育对象有学生、事业单位员工、企业单位职员、农民等，具有有序差异性；根据教育对象的有序差异，教育内容也随之改变，对学生的爱国主义教育内容倾向于传统文化教育、革命历史教育、国家安全教育等，而对农民群体的爱国主义教育内容则多为政策教育，虽然教育内容有一定差异，但是相互之间并不矛盾，面对这不同的受教育群体，有序地运行着，具有有序层次性。另外，爱国主义教育系统内虽然有众多子系统，但是就其子系统的运行方向看，是整体有序地朝着爱国主义教育工作的有效实施运转的，是为爱国主义教育系统的功能服务的。