功能性行为评估指的就是对与问题行为有关的一系列前奏事件、行为、行为结果方面的资料进行收集与分析，并在此基础上确定问题行为产生的原因，制定干预措施和指导个体适当的积极行为。功能性行为评估所关注的核心不是问题行为本身,而是问题行为与个体和环境变量之间的功能关系.通过对特殊儿童的问题行为进行功能性评估后，可以发现引起特殊儿童问题行为发生的环境因素（包括背景事件、前期原因和最终后果）和特殊儿童内在因素（如技能水平、理解能力、语言表达能力等）的原因，基于此评估上制定干预策略，最终可以帮助特殊儿童培养积极行为。
功能性行为评估需要获得每个特殊儿童的“可信而有效的信息”，包括他们存在的问题以及问题行为相关的各种因素。因此，功能性行为评估的实施方法是多样的，主要有资料收集法（Informant Methods）、直接观察法（Direct Observation）和功能分析法（Functional Analysis Manipulations）。
1、资料收集法
资料收集法，又称访谈法。主要通过研究对象的教师、家长的重要他人提供与行为问题相关的资料，访谈的重点是行为问题的历史和可能预测并维持行为问题的事件，具体内容包括：问题行为是什么？问题行为前正发生什么事情和情境或身体条件？了解问题行为发生时的特定情景，什么行为后果在维持问题行为？寻找适应替代的行为有什么？从先前无效、部分有效或短暂有效的行为支持策略中，可以获得哪些启示？
鉴于非结构式的访谈所收集的资料是有限，因此需要配合结构式问卷、等级评估表、心理量表等工具，使资料收集更加完整。国外最常使用的评估工具包括功能评估访谈表（Functional Assessment Interview）、行为动机评价表（Motivation Assessment Scale）和行为功能问卷（Questions About Behavior Function）。
2、直接观察法
直接观察法指的是在自然环境下对研究对象进行系统的观察，通过观察深入了解不同情境下发生问题行为的情形，评估行为的前因后果。直接观察也需要做好相关行为问题的记录，主要使用行为散布图（scatter plot）和A-B-C（Antecedent Behavior Consequence）行为观察法结合而成的观察记录表。
行为散布图是记录问题发生的时间和次数的数据表，评估这观察并记录对象在一天中出现各种行为的频率，使用不同的标记注明高频率和低频率行为。收集数据若干天后，便可从 表格中获得问题行为出现的模式，即行为出现的时间按和与问题行为有关的具体活动。
A-B-C行为观察法则是给予行为主义理论基础上的行为记录表，其中A是前提时间，即问题行为出现前发生了什么事；B时问题行为本身；C时行为结果，即问题行为出现后发生的事情。通过该表的数据分析，评估者能够对特殊儿童的问题行为有了更加细致的了解，为干预策略提供详细的数据指导。
3、功能分析法
功能分析法时功能性行为评估中最重要且最严谨的评估方法。它利用标准化的实验程序和设计，进行系统化的操作，现就问题行为的功能提出假设，然后通过实验的方式，有系统的操作可能会影响问题行为的变量（如任务的难度、任务长度、活动中提供的注意力水平等），接着再观察行为发生前后的变化，找出问题行为的功能。
功能性分析需要特定的实验情境，主要分为：正强化、负强化和感觉刺激与调整。最常使用的实验情景时引起注意、获得实物或者游戏、逃避独处、被忽视或不喜欢的任务等。