1.教师队伍问题
目前教学团队的整体素质不容乐观。主要存在这些问题。专职教师人数少，临时教师人数多。教师团队主要由志愿者，公派教师和当地教师组成。志愿者任期一般是一到两年，期限结束后，大多数人不在原来这个国家继续任教，而是选择回国，或选择其他国家继续任教。公派教师的任期大多数情况下是两年，通常情况下，他们也存在这样的问题。从长远看，此发展态势不利于教师队伍的建设、不利于孔子学院的发展、不利于学生的汉语学习。针对这一现象，不妨做出如下改变：
第一，从教师自身讲，不管是志愿者还是公派教师，一定要有夯实的汉语言基础知识和深厚的中华文化知识，同时强化自身对外汉语教学技能，成为对外汉语的合格教师。第二，从孔子学院管理层面讲，建立一支用于对外汉语教学的全职常备军。一群具有对外汉语教学经验的教师，它不仅有利于提高对外汉语教学质量，而且有利于孔子学院的长远发展。第三，对于本土教师来说，他们熟悉当地的语言及文化知识，这是他们自身最大的优势，是其他类别的对外汉语教师所无法比拟的。由于他们是本土人，自然而然地，他们在推广汉语及中华文化时，与中国对外汉语教师相比，有着更大的便利，更小的阻力。对于他们的培养方式，可以是在孔院内部接受培训，也可以，遣送他们到中国接受培训，这种在中国的直接培训效果更为显着，更有利于提高他们的专业水平。他们所得到的汉语言知识、中华文化更为系统化。但是，这种培养方式的花销成本较第一种方式而言也更高。但是有一个现象不能忽视，就是说，孔子学院培养这些学生的最初目的旨在建立本土化的教师队伍，但是，特别是在贫困地区，这些人在经过孔子学院专业的、系统的培养之后或者在被派遣到中国接受更为专业、更为系统的汉语言知识、中华文化知识、教学技能的培训之后，纷纷转行。孔子学院创建当地教师团队的最初计划无果而终。其原因是，在贫困落后的地方，教师的各个方面的待遇不好，他们既然已经比较娴熟的掌握了一种技能，他们完全可以靠这门技能吃饭，他们想有更好的发展空间、更高的人生追求，不想在这个穷困的地方一直呆下去。所以，他们有的去到了中资企业、有的去到了他们国家的外交部门做了一名翻译、有的干脆直接来到中国找工作，等等。正如孔子学院的主要负责人许琳女士讲的，要解决这一问题，可以提高这些本土志愿者的薪资待遇，按照孔子学院任课老师的薪酬水平来给他们发放工资。以期望留住这些经过孔子学院培养的本土教师。
2.教材问题
目前对外汉语教学中的教材问题不容小觑。教科书陈旧，乏味，质量低劣。值得提的一点是，教材普遍缺乏针对性。这是亟需解决的问题之一。为了提高教学水平、实现最优的教学效果，推动孔子学院的持续发展，有必要做出如下改变：
第一、践行针对性的教材编写原则。运用比较分析理论，将学习者的母语和目标语言进行详细的分析和描述，预测学习者可能出现的错误。同时将这些错误进行难度等级的排序，真正体现出针对性的教材编写原则。同时，进行文化之间的对比，帮助学生了解本土文化与中华文化的异同之处，以此深入了解中华文化的特质。第二，教科书根据学习者的个体因素编写。我们知道不同的学习者有着不同的学习目标、学习动机，以及他们的起始水平是不同的。年龄不同、接触的汉语时间不同，这些都应该是对外汉语教材编写时要考虑的因素。第三，采取中外合作模式编写教材。中方拥有系统的汉语基础知识，外方拥有本土的语言和文化知识，在编写教材时，可以将他们巧妙地结合在一起，学习者会感到非常有趣，从而提高第二语言学习者的积极性，教材的本土化与国别化淋漓尽致地体现了出来。第四，不妨将教材的编写与市场化相结合，以市场的活力推动对外汉语教材的改革，推动教材的多样化。国内还是有不少教学经验丰富的一线对外汉语教师编写的优质教材，对这一部分教材应该加大力度去推广、去使用。
3.经费问题
我们知道孔子学院的启动资金是由中方支付，后续资金由中外方共同出资。出资的比例是1：1，就如许琳女士说的，我们中方这边出一块钱，外方院校出一块钱。我们共同创办这个学院。正如上文所提到的，这个学院的性质是非营利性的，那它是如何维持机构的正常运转的呢？是的，绝大部分依靠政府投入经费。如“2008年，美国芝加哥市为当地孔子学院及其汉语教学提供了443万美元的资金（Yang）；2010年，阿巴马州政府拨款800万美元给特洛伊州立大学孔子学院。”可以看出，在资金这方面，孔子学院更多的政府的投入。如德国的歌德学院，他们更多的是民间组织，他们以市场化的方式运转，所以，他们不会受到猜忌，比如，有人会质疑天底下哪有免费的午餐？中国的非营利性的孔子学院是不是暗藏着某种政治阴谋？中国的孔子学院现在最主要是汉办拨款，但是这样的单一的资金来源使孔子学院的生存能力薄弱，不利于自力更生、自主发展。根据各国语言和文化传播机构的经验，在语言文化传播的早期阶段，国家的财政拨款往往是不能缺失的。然而在语言文化传播进入正轨、确定了其优势地位之后，它可以采取市场化的模式，与当地社会接洽，多模式经营，获得较高的自营收入，踏上市场产业化的经营之路。例如，英国语言文化协会和德国歌德学院，英国语言文化协会，2007年的财政总收入为5.6亿英镑。政府补助占总数的35％，委托项目占总数的20％。各种项目服务的自营职业收入比例为45％。德国的歌德学院，2007年总收入是1.8亿欧元，1.8亿的收益包括总部和各个海外分支机构的收入，其中德国政府的拨款为1.3亿欧元，占比为百分之七十二。从中我们可以看出，要想实现自营收入占比很高的一个目标，还需要一个长期的发展过程，这也是我们孔子学院未来的一个发展方向。
4.文化与语言的关系问题
孔子学院无孔子？有人说，孔子学院打着孔子的旗号，却无孔子思想之实质。目前，国外大多数孔子学院都开展了一系列中国文化体验活动，如太极拳，中国菜，中国服饰，中国茶艺，中国书法，中国戏曲，中国针灸等。不可否认，这些精彩、绚丽、奇妙的文化体验活动博得了本土人的眼球，拉近了当地人同中国的心理距离，它吸引了大量的本土学生去学习汉语，了解中国、窥探中华文化，在一定程度上，促进了中华文化在海外的传播和发展。但是，中华文化不仅仅有物质文化，还有精神文化，这两种文化中，刚刚提到的太极拳、中华美食、中华服饰、中华茶艺、中国书法、中国戏曲、中国针灸等，这些只是表层文化，只是物质文化，这种文化在传播方式上更容易使人接受，在传播效果上更为显而易见，在传播的难度等级上处于相对低级的层次，所以，相比精神层面的文化传播，物质层面的文化传播更容易使人所接受。然而，精神层面的文化才是中华文化的核心和实质，是一个国家、一个民族内在文化最核心的体现，是一个国家主流价值观的体现。孔子学院肩负着推广中华文化的使命，是不可或缺的神圣民族事业。为了实现孔子学院的既有定位，发挥它预想的作用，不妨做出如下改变。