如今，西田几多郎的宗教论与清泽满之的《宗教哲学骸骨》之间的比较研究成为了一大热点问题。不过，不管怎么说，《善的研究》之中的宗教论，可谓是日本人最初站在真正的哲学观念的立场，由此而力图阐明宗教的本质的第一部专门性著作，因此在日本的宗教哲学领域具有里程碑式的重大意义。《善的研究》的第四编“宗教”部分的论述主要围绕着宗教本质和神这两个概念。以下简略说明西田对其中几个重要问题的概述。
（1）宗教的要求
在西田看来，所谓“宗教的要求”，就是“对自我的要求，也就是关于自我的生命的要求。我们一方面知道自我是相对有限的，同时又想同绝对无限的力量结合，以求由此获得永远的真正的生命，这就是宗教的要求。”在此，西田开宗明义地将“宗教”把握为了自我立场下的“宗教的要求”，由此而进一步指出“真正的宗教是为了寻求自我的转变和生命的革新。”不言而喻，将宗教与自我结合在一起，乃是西田的“宗教哲学”的最为本质之处。事实上，就任何宗教说来，宗教首先是来自人们内心的共同的要求。
西田的“宗教的要求”，在此并非特指基督教，但是西田却始终不忘基督教，多次借助它来寻求宗教的理解。西田指出：“正如圣保罗所说的，‘现在活着的，不再是我，而是基督在我里面活着’那样，要把一切肉体生命都钉在十字架上，只希望依靠神来活下去的那种感情。真正的宗教是为了寻求自我的转变和生命的革新。基督手执十字架说，‘不与我一伙的，就是敌我的’，可见一个人只要还有一点点相信自己的念头，就不能说他抱有真正的宗教。”也就是说，人的自我是相对有限的，因而不能相信自我，而要寻求自我的转变，力图获得永远的真正的生命，只能依靠“神”才能实现。在此，自我的否定与神的肯定直接结合在一起，主客未分的绝对否定转换为了绝对性的神。
宗教的要求是“意志统一的要求，同时又是同宇宙相合一的要求”，[ 西田几多郎著、何倩译：《善的研究》，北京：商务印书馆，2010年，第129页。]因此，可以说宗教的要求是人心中最深、最大的要求。西田认为，人类具有的各种肉体上的要求和精神上的要求，都只是自我的局部要求，惟有宗教才是自我本身的解决。宗教寻求的是知与意未分以前的统一，因此，只要是“想认真地思考和认真地生活的人，都能感到热烈的宗教要求的”。
（2）“神是什么”
针对“神是什么”的问题，西田指出：“我们的所谓神，必须是天地由之而定位，万物由之而生育的这种宇宙的内在统一力。”也就是说，神不是处在宇宙之外，而是“宇宙的根本”，“实在的根基”。我们必须承认，外面在自然的根基里有一个统一力的支配，内面在人心里也有一个统一力的支配。因此，“所谓精神与自然的统一，不是把两种体系统一起来，而是指它们本来处于同一的统一之下。”“所谓神就是这种实在的统一者。”西田把这种“统一力”叫做“人格”，那么，神就是“作为宇宙的根基的一个大人格”，“宇宙是神的人格的表现”。
西田主张“神人合一”的立场，何谓“神人合一”，就是我们打破自我的躯壳，或者说超越自己的意识框架，与“绝对无限的力量”成为一体。作为例证之一，西田列举了19世纪英国诗人阿尔弗雷德·丁尼生（Alfred, Lord Tennyson，1809-1892）的体验，并提到：“诗人一旦沉静地吟唱起自己的名字，其个性化的自我就会从个人意识的深处开始逐渐解消，转变为无限的存在。而且，在这一时刻，诗人的意识绝不是朦胧的，而应该是最为清晰的。”作为奥地利精神病医师、心理学家、精神分析学派创始人的西格蒙德·弗洛伊德（Sigmund Freud，1856-1939）认为，人在降临人世之初，自我与外界之间并不存在什么区别。对此，西田也在《善的研究》第四篇第一章《宗教的要求》这一部分，一边列举18世纪的法国哲学家埃蒂耶那·博诺·德·孔狄亚克（Etienne Bonnot de Condillac，1714-1780）的名字，一边叙述指出：“我们在一开始看到光的时候，与其说我们那个时候正在看光，倒不如说我们就是光本身。对于婴儿而言，所有的最初的感觉必然就直接是宇宙本身。”
不仅如此，西田还直接参照了德国思想家雅各布・伯麦(1575-1624)的思想，来阐述自己的“内在的再生”这一观点。他提到：“正如雅各布・伯麦所说的那样，我们依照最为深刻的die innerste Geburt而接触到神，我们在这一内在的再生之中直接面对神，信仰神，与此同时我们也在这里找到自我的真正生命，感受无限的力量。”由此可见，西田提倡的“神人合一”，不仅是感受神的存在，同时也意味着自我的新生命的诞生。
（3）神与世界
最后，西田论述了神与世界的关系，提出“神的性质及其与世界的关系就都能通过我们的纯粹经验的统一，即意识统一的性质和它与其内容的关系来认识”。在西田看来，意识内容是通过统一而成立的，离开意识内容便没有统一，二者相辅相成；两者“只是同一实在的两个方面”。而爱是人格的要素之一，那么，作为恶的存在将如何解释呢？西田认为，世界上本来没有可以绝对地叫做恶的东西，万物本来都是善，应该说实在就是善。“恶是由于实在体系的矛盾冲突而发生的”，该矛盾冲突“是实在发展的一个重要条件”。换句话说，“罪恶、不满和苦恼都是促使我们人类精神上进的重要条件。”从整个宇宙来看，如果认为宇宙是由精神的意义建立起来的话，那就不能嫌弃罪恶，“反而能够知道它们的必要和不可缺少的道理”。西田借用宗教语言说：“罪恶是令人憎恶的，但是世界上再没有比罪恶更美的了。”那是由于“不认识罪恶的人就不能真正认识神的爱。”
围绕“知与爱”的问题，西田强调：“知与爱”并非两种不同的精神作用，而“本来是同一的精神作用”，那就是“主客合一的作用，又是我物一致的作用”。为什么知是与主客一致的呢？西田指出“我们认识物的真像，就是把自己的妄想臆断，即所谓主观的东西消磨净尽，而与物的真像一致，也就是同纯客观一致”，这个时候，才能很好地认识它。站在宗教的视角考虑，西田认为，“主观是自力，客观是他力。”“我们知物和爱物就是舍弃自力而建立对他力的信心。”要认识“绝对无限的佛或神，只有爱它才能做到，爱它就是认识它”。因此，站在宗教的立场，西田在结论之处指出：“我们只有通过爱或信的直觉才能够认识神。”