生鲜农产品电商市场经过2016年重新洗牌后，部分中小型生鲜农产品电商企业倒闭或被并购，而后京东、天猫等电商巨头进入该行业，加大了对生鲜农产品电商配送基础设施的投资，使得生鲜农产品电商市场获得新的发展。此外，在乡村振兴战略推动下，城乡一体化进程获得新的发展格局，由此也产生了新的生鲜农产品物流配送模式。通过文献和调研发现，当前生鲜农产品电商物流配送模式主要包括以下三大类：
一是电商平台自营物流配送模式。该模式下，用户在生鲜农产品网购平台上下单后，电商平台通过自营物流渠道，将生鲜农产品直接运输到消费者手中，在末端配送过程中不经第三方参与。自营物流配送模式直接提高了配送信息传输的时效性，使农户与消费者保持畅通沟通与联系，但该模式下要求自营冷链物流，需要较高的投入成本。
二是电商平台依托第三方的物流配送模式。该模式下消费者完成下单订购后，第三方物流公司对接农户，运输到公司后再将生鲜农产品进行处理，最后运输配送到消费者手中。该模式增加了运输配送的专业性，特别冷链处理过程，极大降低了农户或平台的配送成本。但也增加了信息流通的不对称性，并降低了农户或平台的利润率。
三是综合配送模式。该模式下涉及多方利益相关者，主要依托电商平台，将生鲜农产品通过平台自营物流方式以及第三方物流企业的合理分工，将生鲜农产品配送到消费者手中，该流程涉及农户、物流配送综合体和消费者等多方利益相关者。综合利用各方资源，实现效用最大化，通过物流配送单元的多元化，一方面保证了配送效率，另一方面也保证生鲜农产品的品质和完整，并降低配送成本，实现标准化处理。但因当前物流体系的不完善，其配送单元多样化易产生不稳定和不可控的问题。