当前，我国部分企业已开始实践智慧物流，政府在智慧物流发展方面也给予了政策扶持，然而我国智慧物流，远远落后于日美等发达国家，无论是智能物流基础设施方面，还是物流信息标准、信息化平台服务
（一）智慧物流基础设施薄弱
与发达国家相比，我国智慧物流起步较晚，物流基础设施、互联网基础设施的智能化水平严重不足，导致物流各个环节之间很难实现智能化匹配和运作。智慧物流基础设施薄弱主要表现为全国性物流枢纽布局不够完善、区域性智能物流配送中心比较落后以及商业物流基础设施综合服务能力较差等多个方面。尽管我国已经在传统物流数字化改造、国家智能物流骨干网建设等方面进行了大量投入，为物流行业的降本增效做出了贡献，然而总体来讲，公共物流基础设施建设布局还存在很多问题，如顶层设计与规划路线匹配度不强、智能物流投融资错位以及城乡配送体系仍然薄弱等等，制约了很多优质物流园区向多功能一体化方向发展的速度，影响了智慧物流发展的总进程。很多区域性物流配送中心的作用还局限于存储和自用阶段，尚未完成智能化升级改造，无法发挥社会化服务功能。部分城市，尤其是一些中小型城市，商场商圈、商业步行街还没有布局公共仓储分配中心，信息共享化水平仍然处于低级阶段，公用型快件末端重复建设，自提设备应用范围小，尚未在众多社区和商圈推广开放。
（二）智慧物流信息平台和信息标准落后
面向用户发布信息与共享服务的物流信息平台，是物流企业不可或缺的核心竞争力。2016年，全国7000多万家中小企业和个体工商户之间缺乏信息互联互通，“信息孤岛”现象突出，物流数据基础设施指数值仅为18.8，尚处于起步发展阶段。信息技术落后、信息交换不畅以及信息资源整合能力弱，成为物流企业优化业务过程、构建信用评估体系、获取正规金融资源的重要障碍。物流信息平台的应用功能也没有得到应有的发挥，目前大部分企业的物流信息平台主要用于信息发布，很少有企业能够利用信息平台实现物流金融、物流交易、共享监管以及供应链管理一体化服务等应用功能。为了消除不同企业之间的信息沟通障碍，需要实现物流企业平台与生产系统、流通系统平台的数据交换和信息对接以及系统间的整合互动，并且要使得相关代码标准化。目前，我国物流信息普遍缺乏基础标准，物流企业平台与客户生产、运输系统等平台的信息系统接口不一致，相关业务标准与技术标准的制定和修改也很难满足物流发展的需求，一方面客户无法按标准实现大批量业务数据录入，另一方面众多个性化接口降低了物流企业的作业效率。值得注意的是，物流信息平台和信息系统各自为政，物流网络互不兼容，不仅会导致产业链企业系统之间的信息交换、信息共享和业务协同很难实现，更重要的是增加了商品从厂家到达消费者的时间和成本。
（三）智慧物流社会监管和保障体系不健全
智慧物流本质上是一个涉及多部门的局部市场，参与主体间的行为协调不同于企业内部上下级的直接控制，更加强调网络化的虚拟组织之间的合作。打破企业边界和所有权限制的网络运作模式使得相关的监管制度，尤其是税收制度无法适应，由此容易滋生部分智慧物流商业模式游走于灰色地带[6]，监管体系不健全也会影响企业创新积极性。智慧物流利用互联网技术打造产业生态系统，过去传统的熟识合作模式将会打破，系统中的参与主体范围会比过去得到极大扩展，维系众多陌生关系，形成常态市场交易，需要更加重视法律法规和社会化诚信体系的建设。此外，大多数中小物流企业由于缺乏科技创新、金融资源和人力资本等高端要素的合力支撑，在物流智能化建设方面举步维艰，尽管引进了智慧物流技术，然而由于没有相应的资金保障，以及智慧物流专业人才的匮乏，大大阻碍了智慧物流的发展速度。