1以审计效能为先导，努力探索垂直型和独立性内审体系
内部审计是公司治理的重要控制和监督力量，而公司治理则为内部审计提供了一个良好的控制环境和制度基础。为适应新的形势，农商行要构建“管理垂直、业务独立”的审计体系，在董事会领导下直接开展审计监督，在董事会下设立了审计委员会，设立内部审计部门，使内部审计成为公司治理结构的一个重要组成部分。通过健全自上而下的审计体系，建立从董事会—审计部门经理—专职审计员—农商行审计小组兼职审计员的全方位、立体化的“四级”审计监督网络，组成坚强的审计体系，提高审计独立工作效率和质量。
2以风险识控为基点，牢固树立监管型和效益性审计理念
内部监控离不开内部审计，内部审计是内部监控的基本手段和重要内容。因此，农商行要以风险管理和内部监控为基点，牢固树立监管型和效益性审计理念，将审计工作介入风险管理全过程，把对农商行风险管理过程的评价和报告作为重点，运用风险导向的审计技术、方法，根据风险高低来确定审计范围、内容和重点，通过对内控制度的测试、评审，把不完善、不合理、不严密的环节、程序和方法查找出来，从风险识别、衡量、化解等方面提出改进建议，帮助管理层克服管理上的薄弱环节，堵塞漏洞，避免失控，使之健全有效，真正达到科学管理，提高经济效益的目的，切实为农商行业务经营发展服务。
3以班子建设为根本，精心打造复合型和专业性审计队伍
作为业务经营活动“监督官”的审计人员是审计工作的第一要素。因此，加强审计队伍建设，提高审计人员素质，是提高农商行内部审计工作水平、发挥内部审计职能的根本保证。按照知识结构“复合型”、业务技能“专业性”的要求，配备审计人员，强化班子队伍。对新配备的审计人员注重不同岗位工作经历，加强业务培训学习，不断更新审计人员知识结构。应注重探索和建立科学、有效的激励和约束机制，培育良好、健康的内部审计和控制文化。
4以技术流程为核心，全面推行规范化和科技型审计方法
农商行鉴于自身审计工作现状，应从制度流程、审计技术、科技手段、非现场监管等方面入手，加快审计模式创新，整合审计流程资源，极力打造符合农商行自身实际的规范化、科技型和科学化的内部审计架构，从而实施有效的内部审计工作。要强化制度建设，全面规范审计流程。推进审计工作的规范化、程序化、科学化，建立严格的责任追究制度，明确审计职责，落实审计责任，从而高效开展审计工作。要注重方法技术，大力推行科技审计。改变审计重点基本上凭经验确定的惯例，将事后的审计监督向事前和事中审计转变。研发适合农商行自身审计工作实际的专门审计软件，运用计算机的查询、筛选、排序、统计计算等功能进行审计。要加强非现场性审计。充分利用计算机辅助审计、数据报送分析和计算机信息系统等加强和实施“非现场”审计，使风险控制重心前移，识别异常波动的成因，找出高风险业务领域和风险控制点，提高审计监督的针对性和准确性，真正建立起风险防控和预警机制，实现动态、有效的监督。
5以防治结合为抓手，大力加强预防性和治理型后续审计。要本着“边审计、边辅导、边规范”的原则，对审计中发现的问题及时提出整改意见，限期整改，有计划地分期落实后续审计；为每个被审计单位建立审计台账，保证一单位一档一卷，收集被审计单位相关信息，为做好后续审计工作打好基础；按计划对被审计单位进行“回头望”，对整改事项予以督查，整治到位，确保每审计一个单位，规范一个单位。要抓好审计惩罚处置。在审计中要敢于动真碰硬，加强推进问责机制，在原则面前决不让步，做到每查必纠，纠必罚处，以高强度处罚力度来蔓延高质量的审计震慑力，以达到惩前而毖后之良好效果。