福建省福清市上迳镇东林村是隐元（1592-1673）的出生地。古代上迳被称为灵德里，这里有一座千年古寺印林寺，正是隐元与佛门结缘之圣地。隐元俗姓林，名隆琦，俗名子房，字曾昺，排行三，父德龙，母龚氏。
明代《八闽通志》载：“迳港市在灵德里，及海舟所聚处也”。古代的灵德里，迳港市井繁荣，闻名遐迩。传说中的迳港就位于迳江岸边，江上横跨着宋代的蹑云桥，桥下就是昔日的码头，岸边至今还残留着盐仓石材建筑物，近处还屹立着明代的鳌峰石塔，迳江东流入海，不远处就是现在的福清江阴港。古代的迳港水深江阔，航海发达，商人云集，是迳江沿岸物质集散地，莆仙商人通往龙高半岛和平潭的必经之地，也是这一带居民通往海外的始发地。这里至今流传着林家18子弟漂洋谋生遇难的可歌可泣、催人泪下的动人故事。上迳镇林姓人口居多，镇古街左侧有一座林氏祠堂。迳江林氏“子孙兴旺，代有贤人”，迳江周围林姓皆归属于这座林氏祠堂。
长崎有两家林姓唐通事家族，与隐元同乡同姓，并保持密切的关系。其中一家是林时亮（公琰），另一家是林楚玉。他们是否同宗，是否出之同一支系？为了考证这个问题，笔者分别探访了林时亮、林楚玉、林子房（隐元）的出生地。
林时亮（1598-1683），字公琰，俗称林一官，明万历二十六年（1598年）出生于福建省福清县化北里钱林村，也就是现在的福清市港头镇前林村。据前林村手抄本《长林族谱》开头记载，入闽始祖林禄公的后孙有，十六世披公、十七世九牧公。而前林村林氏家谱的一世祖是，开闽始祖林每再公（大明毅武将军，诰赠奉直大夫）；三世祖肇迁前林之始祖林钦仁公；十二世祖：国大公（1529-1604，林时亮祖父）；十三世祖：大侃公（1546-1626，林时亮父亲），国大公次子行五，号瑞如，遭海劫溺水身故，娶北埔郑氏。林时亮属于第十四世，家谱里没有记载林时亮。但笔者认定林大侃为林时亮的父亲，其理由是：第一，林时亮的第十三代嫡孙林陆朗说：“长崎崇福寺祠堂里供奉着牌位，上面写着林时亮（公琰）父亲的名字——瑞如”。第二，著名唐通事、诗人、书法家林道荣（林时亮长子），在其书法作品上的落款是：瑞如公之孙、公琰公之子林道荣；第三，林家家谱里明确记载林大侃号瑞如，而且大侃的下一代为“时”字辈，林大侃的亲兄林大佐的两个儿子叫时迪、时善，与林时亮的辈分吻合。
林楚玉（太卿）（1572-1645），福清县灵德里人，日本长崎著名华人。笔者为考证林楚玉和隐元的家世，多次寻访上迳镇上迳村和东林村。迳江林氏祠堂是规模较大的林氏祠堂，这里是迳江林氏的发祥地，始建于明初。明代的林濡翥（1556-1647）就是出自迳江的林氏历史名人。《迳江林氏家谱》记载，迳江林氏，也是入闽始祖林禄公的后代，十六世披公、十七世九牧公与林时亮出生地前林村家谱一致。这一支林氏家世从十八世迈公开始，五代人都是进士，朝廷命官，其中第二十三世林希逸（1193～1271）是南宋末年著名理学家。明代（1368-1644）初期，第二十五世林明哲的后裔的一支从平潭六灶迁入迳江村，始祖是谷仁公，第二代四个兄弟（四房）衍生13干派。“文革”前，迳江林氏各干派都有家谱，可惜“文革”时期多数被烧毁，连始祖谷仁公的墓地也被毁，墓碑用来填海造地。只有少数干派保存相对完整的家谱，但只是简谱，没有记载生卒年以及简历。在第三支诗房乐公的后代中，南山干派家谱就是幸免于难的一个。家谱从第四代维均公开始，一直记录到第十九代（现在），这是维均公五子中的一位廷坚公（文镀）的后孙，另外四支没有记录。第六代五岑（字公纯）——第七代尚晦（四兄弟中排行三，号止庵，字熹卿）——第八代守观（四兄弟中排行二，号仰正，字大胆）——第九代宗城（两兄弟中排一，号荧刑，字氏夫）——第十代德秋（四兄弟中排二，号松希，字士洁）——第十一代百枝（四兄弟中排一，号松如，字茂学）。这家家谱中，第七代21个人，都是卿字辈，第八代4人都是守字辈（大字辈），虽然日本华人林楚玉没有被记录，但辈分正好与第七代（林楚玉，字太卿）和第八代（子林守殿，字大堂）完全吻合。而且从始祖谷仁公开始推算（按一代30年算），卿字辈在世的年代为16世纪后半期，而林楚玉出生于1572年，所以年代也基本吻合。由此可判明，林楚玉就是出生于上迳的迳江林氏南山干派第七代后孙。
隐元的家世，因迳江林氏家谱不完整，已经无法核实，而且《迳江林氏家谱》里没有东林村干派。根据《迳江林氏家谱》等有关文献，找到几个与隐元有关的信息：一是，迳江林氏中，与隐元有交往的著名人物是林汝翥（1556-1648，字大崴，号心弘）。林汝翥是迳江林氏第八代，明代官职为四川监察御史，隐元东渡日本之前，作为福清黄檗山万福禅寺的护持，鼎力支持过隐元，在《新纂校订隐元全集》中有三篇是写给林汝翥的法语、诗偈和信函。二是，隐元排行三，俗名子房，有一兄叫林子春，其子叫林汝默。如果林汝翥与林汝默是同辈，那么隐元就是迳江林氏第七代。三是，国内有些文献记载隐元出生于灵德里，日本文献也都说隐元出生于福清上迳镇东林村，而且东林村离迳江林氏发祥地迳江村很近（只隔几里）。四是，日本《黄檗东渡僧宝传》记载，隐元是“八闽望族林氏之后”，这种说法与《迳江林氏家谱》记载一致，迳江林氏从十八世迈公开始，五代人都是进士，朝廷命官，只是到了隐元父亲林德龙的世代逐渐没落，家境贫寒。五是，隐元与迳江林氏林楚玉关系很密切，隐元特别关爱大通事林守壂。
通过以上分析与考证，可以判明隐元、林时亮和林楚玉都是入闽始祖林禄公的后孙，隐元与林楚玉属于同一支、不同干派，林时亮则属于林每再公支系。