任何事物都有两个方面，既有积极的一面，也有消极的一面，税务代开发票也是如此。由于税务代开发票具有很高的可信度，能为单位带来实实在在的经济利益，许多经济活动单位就利用这个优势，千方百计寻找机会大打“擦边球”，以便从中捞取不法利益，给税务代开发票蒙上一层阴影，有的已经成为不法经营者的挡箭牌，应当引起各级各单位的高度重视。其一，利用税务代开发票套取资金形成单位的“小金库”。从已查出“小金库”的资金来源看，有相当部分是利用税务代开发票套取的资金，即：将子虚乌有的业务由本单位到税务机关代开发票，套取资金扣除缴纳的税款后，全部进入单位的“小金库”；也有的将发生业务量小，而开具金额较大的税务代开发票，从差额中套取资金；还有的将发生的业务张冠李戴从税务机关代开发票，使违法行为合法化等。利用税务代开发票形成“小金库”的行为，严重损害了国家及单位的利益。其二，有些企业利用税务代开发票套取利差。目前，我国流转税税率最低的是建筑税，其基本税率及附加税费之和最高为3.3%，而居民所得税税率为25%，相对差额为21.7%。有些企业就从中看出套利的门道，想方设法利用税务代开发票作掩护，编造种种理由在税务机关代开发票以虚增成本，使本来盈利的企业变为收支持平，有的甚至变为亏损，以便从中赚取这个利差，使国家税收遭受损失，而单位却获取不法利益。其三，将非法支出合法化。从检查的情况看，有些单位为了单位小集团利益，利用税务机关不能实地查看业务发生的局限性，故意将不合法支出合法化。如将不当的职工福利支出，在税务代开发票中开成办公用品；将不当的请客送礼支出，开成各种维修及维护费用；有的甚至将行贿支出，也捏造为单位联系业务的手续费支出等，使用各种手段给灰色支出及违法支出，披上由税务机关认可的合法外衣。其四，为单位财务管理表面规范化铺路搭桥。当前，经济责任审计已经普及到省部级领导干部的行列中，领导者或管理者无论升迁、调任，还是届满继续留任，均要经过经济责任审计之后才能定论，这种趋势给领导者或管理者在任时增加了一定的压力，即在位时的所作所为要经得起审计。实际中，有些单位的领导者或管理者在位时经不起权力的诱惑，想方设法为自己捞取额外好处，违法乱纪就是惯用手段之一，但又要顾及到个人的声誉。如何使违法行为合法化，于是许多单位的领导者就在税务代开发票上大做文章，将一些不合法的经济活动，通过税务代开发票的方式加以掩饰，以便应付经济责任审计，确保领导者或管理者名利双收。这种表面合法而实质不合法的做法，既不能反映单位经济活动的真实情况，而且还败坏了执政党的党风、政风及单位风气；更不能容忍的是，有些弄虚作假者往往就是用税务代开发票充当挡箭牌，使其金蝉脱壳，这是法律法规所不允许的。